RNA–Protein interactions for RNA: YML125C

PGA3, Transcript of Putative cytochrome b5 reductase, localized to the plasma membrane, yeast

Gene PGA3, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PGA3	YML125C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PGA3	YML125C	RPN13	O13563	156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	OPI3	P05375	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SIR2	P06700	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PDX1	P16451	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NFS1	P25374	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	AHC2	P25649	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PPA2	P28239	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	THI4	P32318	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MCM10	P32354	571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	COS9	P36034	407 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RSM22	P36056	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PAU24	P38155	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PAM16	P42949	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	IMO32	P53219	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YGR066C	P53242	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PAU12	P53343	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MKC7	P53379	596 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	BNA7	Q04066	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	GPN3	Q06543	272 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MIM1	Q08176	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	GRE1	Q08969	168 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YPR1	Q12458	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	FRE6	Q12473	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MDH2	P22133	377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	STE50	P25344	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	BOS1	P25385	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ATS1	P31386	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	VPS17	P32913	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PHB1	P40961	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	POP1	P41812	875 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PMT6	P42934	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PRY1	P47032	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CIK1	Q01649	594 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RSM24	Q03976	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HLR1	Q04429	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YMR252C	Q04814	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	BAG7	Q12128	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HMS1	Q12398	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	FLO9	P39712	1322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PDE2	P06776	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	COX9	P07255	59 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	HMG1	P12683	1054 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	STE18	P18852	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	UTR1	P21373	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	DOA4	P32571	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MOH1	P38191	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PEX32	P38292	413 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YHK8	P38776	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YEL057C	P39983	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YIL169C	P40442	995 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MNN5	P46982	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CCC1	P47818	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	BSC5	P53755	489 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MSS11	Q03825	758 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NNT1	Q05874	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	CTS2	Q06350	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PEX27	Q08580	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MSW1	P04803	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	NPL6	P32832	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	RPC34	P32910	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	ZRT3	P34240	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MTH1	P35198	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
PGA3	YML125C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	YBR137W	P38276	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	FCY21	P40039	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	SER2	P42941	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PGA3	YML125C	MSY1	P48527	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms