RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PDR18	P53756	1333 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RIF1	P29539	1916 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	PTP1	P25044	335 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YMC1	P32331	307 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	KAR9	P32526	644 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MCH2	P36032	473 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	CHS7	P38843	316 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MST28	P39552	234 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YER184C	P39961	794 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	VRG4	P40107	337 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YIA6	P40556	373 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	MGA1	P53050	456 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YMR181C	Q03231	154 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	SNX41	Q04053	625 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	TPO3	Q06451	622 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YCT1	Q12235	531 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	DCN1	Q12395	269 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YLR111W	Q12528	110 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RPS1B	YML063W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	QCR2	P07257	368 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CAP2	P13517	287 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	TFS1	P14306	219 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	MBR1	P23493	339 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	COQ3	P27680	312 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SHG1	P38337	142 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RTS2	P40962	232 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	AIM23	P47015	356 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YJR012C	P47087	207 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YJR079W	P47126	109 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	VPS25	P47142	202 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	IBA57	P47158	497 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	MRM2	P53123	320 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CCE1	Q03702	353 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	PEX12	Q04370	399 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	PRM6	Q04705	352 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	BCH1	Q05029	724 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	NNT1	Q05874	261 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CTR3	Q06686	241 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	POM33	Q12164	279 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CTA1	P15202	515 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YCR102C	P25608	368 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CHK1	P38147	527 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	BMT2	P38278	337 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	AME1	P38313	324 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	VAB2	P40003	282 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YIR016W	P40572	265 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	GDS1	P41913	522 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	GWT1	P47026	490 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YJR030C	P47101	745 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YJR149W	P47177	404 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	UBC13	P52490	153 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	VEL1	P53058	206 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	USE1	P53146	245 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YNL234W	P53857	426 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	STP1	Q00947	519 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	MRS2	Q01926	470 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	CTF19	Q02732	369 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	THI7	Q05998	598 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SEC10	Q06245	871 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YEH2	Q07950	538 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	ESA1	Q08649	445 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	JLP1	Q12358	412 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	PRM4	Q12498	284 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SPT3	P06844	337 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	HEM15	P16622	393 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	IFM1	P25038	676 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	POF1	P25576	258 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	FIG1	P38224	298 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	RPH1	P39956	796 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	YIL169C	P40442	995 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	IRC18	P47056	224 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
RPS1B	YML063W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.4 ms