RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	HAP1	P0CE41	1502 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	REP1	P03871	373 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	ACB1	P31787	87 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	ACP1	P32463	125 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SSO2	P39926	295 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	MSS2	P40990	351 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	BNA6	P43619	295 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	ZRG17	P53735	605 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	GMC1	Q04399	608 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	BUR2	Q05949	395 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	BOP2	Q06150	570 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	CUR1	Q06469	252 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	BTS1	Q12051	335 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	PRM4	Q12498	284 aa		2.09	□□□□□ -2.07
YLR224W	YLR224W	SPP41	P38904	1435 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	TRM3	Q07527	1436 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SAL1	D6W196	494 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YAK1	P14680	807 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YPK2	P18961	677 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	COX10	P21592	462 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YSR3	P23501	404 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	ITR2	P30606	609 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YKL187C	P34231	750 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	AST1	P35183	429 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YKL070W	P36087	169 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	PRY2	P36110	329 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SMF2	P38778	549 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	PRM9	P39551	298 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RRG9	P40156	214 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MIC19	P43594	170 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	HSH155	P49955	971 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MIG2	P53035	382 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RMR1	P53060	241 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YGL185C	P53100	379 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MND1	P53102	219 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	TPC1	P53257	314 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	INP1	Q03694	420 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	BNA7	Q04066	261 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YLL007C	Q07799	665 aa		2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.08	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MSF1	P08425	469 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	GAL3	P13045	520 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	CUP2	P15315	225 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	UGA1	P17649	471 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	AGA2	P32781	87 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RCK1	P38622	512 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YER085C	P40058	173 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YIL054W	P40524	105 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SNZ3	P43545	298 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	CPR7	P47103	393 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SDS23	P53172	527 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	TIM21	P53220	239 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MNT4	P53745	580 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SNZ2	P53824	298 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	VPS20	Q04272	221 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	FUS2	Q05670	677 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YLR012C	Q07927	99 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YDL211C	Q12121	372 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RAD9	P14737	1309 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	BCK1	Q01389	1478 aa		2.07	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	APA2	P22108	325 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	ZRT3	P34240	503 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	SWC5	P38326	303 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	YMR262W	P38430	313 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	MTW1	P39731	289 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	COS4	P43542	379 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	PMT4	P46971	762 aa		2.06	□□□□□ -2.08
YLR224W	YLR224W	GTO1	P48239	356 aa		2.06	□□□□□ -2.08

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.4 ms