RNA–Protein interactions for RNA: YPL147W

PXA1, Transcript of Subunit of a heterodimeric peroxisomal ABC transport complex, yeast

Gene PXA1, Length 2,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Peroxisome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PXA1	YPL147W	POF1	P25576	258 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AHC2	P25649	128 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	COS9	P36034	407 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	GOS1	P38736	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YHR122W	P38829	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SHU2	P38957	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YJL193W	P39542	402 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PFA3	P42836	336 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	IKS1	P47042	667 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	COG7	P53195	279 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RAV2	Q03956	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TRM12	Q04235	462 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SSK1	Q07084	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YCT1	Q12235	531 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ERG8	P24521	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VRP1	P37370	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	MIC19	P43594	170 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HOC1	P47124	396 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YGL082W	P53155	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	INN1	P53901	409 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RKM2	Q03942	479 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PEX27	Q08580	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	FEX1	Q08913	375 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SAL1	D6W196	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VMA3	P25515	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YIH1	P25637	258 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	UBC8	P28263	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SPT23	P35210	1082 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VHC1	P38329	1120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YAR028W	P39548	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	DSE1	P40077	573 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	SET4	P42948	560 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PMT4	P46971	762 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	AVT4	P50944	713 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	USE1	P53146	245 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HST3	P53687	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	GPI17	Q04080	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	TRI1	Q05024	226 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	RUP1	Q12242	671 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PXA1	YPL147W	HKR1	P41809	1802 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	AI3	P03877	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	URA3	P03962	267 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	ASH1	P34233	588 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	LST4	P34239	828 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YPT53	P36019	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YKL151C	P36059	337 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	FRM2	P37261	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YBR285W	P38354	144 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	CHA4	P43634	648 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	TDA1	Q03533	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YET2	Q04210	160 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	INM2	Q05533	292 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	EST2	Q06163	884 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	CYK3	Q07533	885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	COS7	Q07788	383 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	MDM32	Q12171	622 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	NUM1	Q00402	2748 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	CTA1	P15202	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	ERD1	P16151	362 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	ACH1	P32316	526 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	IES6	P32617	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.52	□□□□□ -1.69	not detected
PXA1	YPL147W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YOR062C	P36025	268 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	FLO10	P36170	1169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	EXO5	P38289	585 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YHR112C	P38716	378 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	SSN3	P39073	555 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	NSE4	P43124	402 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YFL054C	P43549	646 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YFR057W	P43625	151 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	MDM30	Q05930	598 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	CRD1	Q07560	283 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PXA1	YPL147W	YPL257W	Q08974	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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