RNA–Protein interactions for RNA: YOR317W

FAA1, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA1	YOR317W	SDH8	P38345	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YPS6	P40583	537 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	PAC11	P40960	533 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MRPL22	P53881	309 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SDH1	Q00711	640 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YPL034W	Q03083	165 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	CAC2	Q04199	468 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YML096W	Q04489	525 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	LDS2	Q08218	356 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YNG1	Q08465	219 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	POM33	Q12164	279 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	FSH3	Q99369	266 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MXR2	P25566	168 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	GAC1	P28006	793 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YSC84	P32793	468 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SGE1	P33335	543 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SPC34	P36131	295 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ARP1	P38696	384 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YHR112C	P38716	378 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SYG1	P40528	902 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SNL1	P40548	159 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	FAR3	P46671	204 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YJR030C	P47101	745 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	TIS11	P47977	285 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SCS3	P53012	380 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YGR079W	P53249	370 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YMR321C	Q04898	105 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	AIM41	Q12032	185 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YOR114W	Q12219	294 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	TPO4	Q12256	659 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.74	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SPT3	P06844	337 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RPB8	P20436	146 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MET22	P32179	357 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	REC114	P32841	428 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MRPL6	P32904	214 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MRPL16	P38064	232 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RCK2	P38623	610 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	CTF8	P38877	133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YFL040W	P43562	540 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ALG13	P53178	202 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	PEX31	P53203	462 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	COS6	P53344	381 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	NAT4	Q04751	285 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	OPT2	Q06593	877 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SOR2	Q07786	357 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ATP16	Q12165	160 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RDI1	Q12434	202 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ECM3	Q99252	613 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	POP5	P28005	173 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	DSS4	P32601	143 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	FMP23	P38231	175 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	INM1	P38710	295 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MBB1	P39534	108 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	UBP5	P39944	805 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	IDP2	P41939	412 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	GUF1	P46943	645 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SCW11	P53189	542 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	FHN1	P53279	174 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	CWC27	Q02770	301 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YMR279C	Q03263	540 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	SMP3	Q04174	516 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	MLH3	Q12083	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	YDR018C	Q12185	396 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	DCN1	Q12395	269 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RIB3	Q99258	208 aa		3.73	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	OPI3	P05375	206 aa		3.72	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.72	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	TFC1	P32367	649 aa		3.72	□□□□□ -1.81
FAA1	YOR317W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 46.4 ms