RNA–Protein interactions for RNA: YOL072W

THP1, Transcript of Nuclear pore-associated protein, yeast

Gene THP1, Length 1,368 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP1	YOL072W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	HRT1	Q08273	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	BTS1	Q12051	335 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SEC12	P11655	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	IRA1	P18963	3092 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RAD51	P25454	400 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	FUN26	P31381	517 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	EMP70	P32802	667 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YKL071W	P36086	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MAL32	P38158	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RPP1	P38786	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YHR180W	P38868	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	FET3	P38993	636 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
THP1	YOL072W	HXT9	P40885	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SHR5	P41912	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	GDS1	P41913	522 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ATG18	P43601	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YFR054C	P43622	192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	TYW3	P53177	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	IMO32	P53219	342 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MAL12	P53341	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	HXT11	P54862	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YAT1	P80235	687 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	EKI1	Q03764	534 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YMR252C	Q04814	134 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SEI1	Q06058	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ENB1	Q08299	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RDR1	Q08904	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YPR1	Q12458	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	CAP2	P13517	287 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	CDC26	P14724	124 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	DAL82	P21705	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	CPR2	P23285	205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	BOS1	P25385	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PTC6	P25646	442 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	AHC2	P25649	128 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SPT14	P32363	452 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SLC1	P33333	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ECT1	P33412	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	NIC96	P34077	839 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MTC2	P34246	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	THI2	P38141	450 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	CHK1	P38147	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PAU24	P38155	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	HIS6	P40545	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	NAS2	P40555	220 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MDV1	P47025	714 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MSE1	P48525	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	BRR6	P53062	197 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SAY1	P53324	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PAU12	P53343	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	BUR2	Q05949	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MCP1	Q12106	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PDE2	P06776	526 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	GCN3	P14741	305 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RPB8	P20436	146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	NUP1	P20676	1076 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	PMT2	P31382	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	GPX1	P36014	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.55	□□□□□ -1.68	not detected
THP1	YOL072W	MBA1	P38300	278 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	RTT105	P40063	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	CUP9	P41817	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	IRC18	P47056	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ASK10	P48361	1146 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	ERV29	P53337	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	TDA1	Q03533	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	MSS11	Q03825	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	HLR1	Q04429	423 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	SSK1	Q07084	712 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	AIM6	Q07716	390 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	COQ10	Q08058	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
THP1	YOL072W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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