RNA–Protein interactions for RNA: YLR349W

YLR349W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLR349W, Length 507 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR349WYLR349W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W ULA1Q12059 462 aa7.77□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W TIM9O74700 87 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YOL162WP0CF19 215 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W POL4P25615 582 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W NIC96P34077 839 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W ICS2P38284 255 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RCY1P39531 840 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RSP5P39940 809 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W MPH1P40562 993 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W IAH1P41734 238 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YJL055WP47044 245 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W BAT2P47176 376 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PPT1P53043 513 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W USE1P53146 245 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YNL033WP53964 284 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YNL019CP53975 284 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YMR317WQ04893 1140 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W GGA1Q06336 557 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YLR108CQ12259 485 aa7.76□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RAD7P06779 565 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W HAP4P14064 554 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W CPR2P23285 205 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PEX3P28795 441 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data7.75□□□□□ -1.17not detected
YLR349WYLR349W CLG1P35190 452 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YHR218WP38899 603 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PFS2P42841 465 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W GZF3P42944 551 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W BNA2P47125 453 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W SWA2Q06677 668 aa7.75□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RPL6BP05739 176 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PEX6P33760 1030 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W MRP8P35719 219 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W LNP1P38878 278 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RRN5Q02983 363 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W MSS11Q03825 758 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W BNA7Q04066 261 aa7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W NFT1P0CE68 1218 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YML003WP0CF16 290 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PRP4P20053 465 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W SMM1P53720 384 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W UBP2Q01476 1272 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W HMO1Q03973 246 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W HFD1Q04458 532 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W GPI11Q06636 219 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W YPR097WQ06839 1073 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W SPC3Q12133 184 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W APC2Q12440 853 aa7.73□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W PDE2P06776 526 aa7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W ARO3P14843 370 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W TRS85P46944 698 aa7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W ASI3P53983 676 aa7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W ADH6Q04894 360 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W MHF2Q3E829 80 aa7.72□□□□□ -1.17
YLR349WYLR349W BOS1P25385 244 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ATP7P30902 174 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W DAL3P32459 195 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TOA1P32773 286 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TRM5P38793 499 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YNR064CP53750 290 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W APM1Q00776 475 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W UGO1Q03327 502 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YDR391CQ04170 232 aa7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W APA2P22108 325 aa7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RIB1P38066 345 aa7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PIC2P40035 300 aa7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data7.7□□□□□ -1.18not detected
YLR349WYLR349W USB1Q12208 290 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W ERP4Q12450 207 aa7.7□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W OPI3P05375 206 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W DSF1P0CX08 502 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YNR073CP0CX09 502 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W NTG1P31378 399 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W BAP2P38084 609 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YBR096WP38256 230 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RTC2P38279 296 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YHR035WP38769 630 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W RMD9P53140 646 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W GPI1P53306 609 aa7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W SVL3Q03088 825 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W TIF3P34167 436 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W FAT1P38225 669 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W AGE2P40529 298 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W OST1P41543 476 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W IRC5P43610 853 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YDL186WP48568 277 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W NUP49Q02199 472 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MCH4Q08268 501 aa7.68□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W COX5BP00425 151 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MSW1P04803 379 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MET3P08536 511 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W MSS18P08593 268 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W YKR015CP36111 568 aa7.67□□□□□ -1.18
YLR349WYLR349W STB1P42845 420 aa7.67□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 125 ms