RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	RTT105	P40063	208 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	FMC1	P40491	155 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	PKP1	P40530	394 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	POP1	P41812	875 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	PAC10	P48363	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	MNT2	P53059	558 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	JAC1	P53193	184 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	CAF40	P53829	373 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	PRM1	P53835	661 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	INN1	P53901	409 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	OST6	Q03723	332 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	PLM2	Q04383	521 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	DXO1	Q06349	442 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	MLC2	Q06580	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	SSK1	Q07084	712 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	DCI1	Q08558	271 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	VPS13	Q07878	3144 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	STT4	P37297	1900 aa		4.15	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	QCR7	P00128	127 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ARG80	P07249	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SNF6	P18888	332 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
TVP38	YKR088C	SFC1	P33303	322 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
TVP38	YKR088C	SDH8	P38345	138 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GGC1	P38988	300 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
TVP38	YKR088C	FAU1	P40099	211 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CIN1	P40987	1014 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PAM16	P42949	149 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BNA6	P43619	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BFA1	P47113	574 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	COS10	P52924	374 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ROG1	P53118	685 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MEP3	P53390	489 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MNT4	P53745	580 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	COS1	P53822	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPL014W	Q02606	381 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CCE1	Q03702	353 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	BOP2	Q06150	570 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	IPK1	Q06667	281 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PCL9	Q12477	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.15	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	REP2	P03872	296 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AAC1	P04710	309 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HOP1	P20050	605 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EPT1	P22140	391 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PRE4	P30657	266 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PMT2	P31382	759 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TUL1	P36096	758 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PAU24	P38155	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	AXL2	P38928	823 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	ALP1	P38971	573 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MET28	P40573	187 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	NUP57	P48837	541 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	VOA1	P53262	265 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	PAU12	P53343	120 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	MTQ1	P53944	314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	KAP120	Q02932	1032 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	HLR1	Q04429	423 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RSF1	Q05043	376 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RKM5	Q12367	367 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	FRE6	Q12473	712 aa		4.14	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
TVP38	YKR088C	SEC12	P11655	471 aa		4.13	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.1 ms