RNA–Protein interactions for RNA: YJL141C

YAK1, Transcript of Serine-threonine protein kinase, yeast

Gene YAK1, Length 2,424 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YAK1	YJL141C	RRI1	Q12468	440 aa		3.06	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	HIP1	P06775	603 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	RHO2	P06781	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ELO2	P25358	347 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PDC2	P32896	925 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	DER1	P38307	211 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ARP1	P38696	384 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YHK8	P38776	514 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	VPS52	P39904	641 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	HAT2	P39984	401 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SHO1	P40073	367 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	VFA1	P40080	203 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	POG1	P40473	351 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YJL045W	P47052	634 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PHB2	P50085	310 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YGL138C	P53122	345 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MRH4	P53166	561 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PEX31	P53203	462 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	BUD32	P53323	261 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YPL014W	Q02606	381 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PFA5	Q03289	374 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YLR224W	Q05947	369 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YLR046C	Q12253	270 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YLR122C	Q12312	125 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	TFC7	Q12415	435 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	AAC1	P04710	309 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	NUC1	P08466	329 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ADH7	P25377	361 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PBN1	P25580	416 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	KKQ8	P36004	724 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YKL075C	P36083	450 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PSD1	P39006	500 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PHO90	P39535	881 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	JHD1	P40034	492 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	GAT2	P40209	560 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YJL163C	P46996	555 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	POP6	P53218	158 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YNL260C	P53846	198 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	INN1	P53901	409 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	STD1	Q02794	444 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SHH3	Q04487	196 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	RIF2	Q06208	395 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	CDD1	Q06549	142 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	THI20	Q08224	551 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	TMS1	Q12116	473 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	NMD4	Q12129	218 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	PTC5	Q12511	572 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MOT1	P32333	1867 aa		3.05	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	STE2	D6VTK4	431 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	COX5B	P00425	151 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	NAM2	P11325	894 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SGF29	P25554	259 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.04	□□□□□ -1.92	not detected
YAK1	YJL141C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	AEP1	P32493	518 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SRB5	P32585	307 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YKL070W	P36087	169 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	EHT1	P38295	451 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MBA1	P38300	278 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	IKI1	P38874	309 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	FAA2	P39518	744 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	SPG5	P42933	373 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	TOS3	P43637	560 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	BNA2	P47125	453 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	DIA3	P52290	468 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	VPS28	Q02767	242 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	TDA1	Q03533	586 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	CUR1	Q06469	252 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ATG10	Q07879	167 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ACM1	Q08981	209 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	JLP1	Q12358	412 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	TRM13	Q12383	476 aa		3.04	□□□□□ -1.92
YAK1	YJL141C	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		3.04	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.3 ms