RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C YDL186WP48568 277 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C GPI8P49018 411 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C LCL3P53153 274 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YGR067CP53243 804 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TWF1P53250 332 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TPC1P53257 314 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RBG2P53295 368 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MTQ1P53944 314 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SWP1Q02795 286 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RRN5Q02983 363 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RSM10Q03201 203 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NAT4Q04751 285 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MDM30Q05930 598 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NDL1Q06568 189 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SWA2Q06677 668 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data2.01□□□□□ -2.09not detected
GCN4YEL009C YPL278CQ08990 100 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C VIK1Q12045 647 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C REX3Q12090 404 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C BAG7Q12128 409 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR342CQ12182 319 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TPO4Q12256 659 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MRX4Q12467 430 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOL159C-AQ3E769 90 aa2.01□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPL20AP0CX23 172 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPL20BP0CX24 172 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MRS3P10566 314 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ATR1P13090 542 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CBS1P14066 229 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FBA1P14540 359 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PET9P18239 318 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YCK1P23291 538 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RPS2P25443 254 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PBN1P25580 416 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C UBC8P28263 218 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2□□□□□ -2.09not detected
GCN4YEL009C HCS1P34243 683 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SLM4P38247 162 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MED8P38304 223 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ECM34P38728 170 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ANS1P38832 159 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RCY1P39531 840 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C THO1P40040 218 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PRE5P40302 234 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNL1P40548 159 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MET28P40573 187 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SMK1P41808 388 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AGP3P43548 558 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C VMA10P48836 114 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TOS2P50078 622 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MPC1P53157 130 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DCP2P53550 970 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YLR460CP54007 376 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YPL107WQ02873 248 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDR541CQ03049 344 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C INP1Q03694 420 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YDR239CQ03780 787 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RNH202Q05635 350 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C LOT6Q07923 191 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RAX1Q08760 435 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C AKR2Q12013 749 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOR214CQ12282 236 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C HSP42Q12329 375 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PSF1Q12488 208 aa2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YOL163WP0CF20 169 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PET122P10355 254 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ARF1P11076 181 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C KSS1P14681 368 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C POL4P25615 582 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NAM9P27929 486 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C PTP2P29461 750 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ITR2P30606 609 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SAC1P32368 623 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C MRPL6P32904 214 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C ARC19P33204 171 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SEF1P34228 1148 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SRO77P38163 1010 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NSG1P38837 291 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SPO73P40031 143 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SER3P40054 469 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SIM1P40472 476 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YIL067CP40514 678 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C FAR7P43592 221 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NUP57P48837 541 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SEH1P53011 349 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C SYF2P53277 215 aaPredicted RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C YGR168CP53293 376 aa1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C DBP6P53734 629 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
GCN4YEL009C NCE101Q02820 53 aa1.99□□□□□ -2.09
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