RNA–Protein interactions for RNA: tF(GAA)B

tF(GAA)B, Transcript of Phenylalanine tRNA (tRNA-Phe), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tF(GAA)B, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tF(GAA)BtF(GAA)B AMN1P38285 549 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RRP4P38792 359 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YHR180WP38868 163 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL208WP40159 199 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PRM5P40476 318 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SLM1P40485 686 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B CAF16P43569 289 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AIP1P46680 615 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SSY5P47002 699 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL055WP47044 245 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR154WP47181 346 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TIS11P47977 285 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B MMS2P53152 137 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PEX8P53248 589 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B PIL1P53252 339 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TNA1P53322 534 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B LCL1Q02786 101 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SGF11Q03067 99 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RRB1Q04225 511 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B FSH2Q05015 223 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B RBS1Q05672 457 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B SSQ1Q05931 657 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B IRC19Q07843 230 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B GSH2Q08220 491 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B ENB1Q08299 606 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TY2A-DR1Q12392 438 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B AVL9Q12500 764 aa0.47□□□□□ -2.33
tF(GAA)BtF(GAA)B TRP4P07285 380 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B BGL2P15703 313 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC43P18898 376 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC15P27636 974 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B URA1P28272 314 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B COQ2P32378 372 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ARO4P32449 370 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC3P32457 520 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B STE14P32584 239 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B TOA1P32773 286 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YGL015CP33199 130 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MDL1P33310 695 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SDH3P33421 198 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B HIS7P33734 552 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B VPS21P36017 210 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SHM1P37292 490 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YBR096WP38256 230 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PRS2P38620 318 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B EFM1P38732 585 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B TRM5P38793 499 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RSP5P39940 809 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B EMP65P40085 556 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B FLX1P40464 311 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL218WP40892 196 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL320WP42840 284 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B GCD14P46959 383 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YJL016WP47072 561 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SNF12P53628 566 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NMA111P53920 997 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YDC1Q02896 317 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B TFB2Q02939 513 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B UME1Q03010 460 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YDR391CQ04170 232 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B VMS1Q04311 632 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NKP2Q06162 153 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ASA1Q06822 443 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YOL019WQ08157 551 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RRS1Q08746 203 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NUS1Q12063 375 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YLL056CQ12177 298 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NOP58Q12499 511 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RMD5Q12508 421 aa0.46□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MSW1P04803 379 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B PEP4P07267 405 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RVS161P25343 265 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YCR001WP25347 104 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SYP1P25623 870 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B CDC20P26309 610 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B FUN19P28003 413 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MCM10P32354 571 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NIC96P34077 839 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YOR062CP36025 268 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B MNN2P38069 597 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B OSH7P38755 437 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ANS1P38832 159 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YER034WP40022 185 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YEN1P40028 759 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YNL195CP40168 261 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B AGX1P43567 385 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YJR056CP47115 236 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B STR2P47164 639 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B NUP42P49686 430 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B ALG13P53178 202 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YGR054WP53235 642 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YNR062CP53748 327 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B RHO4Q00246 291 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B UTP6Q02354 440 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SPP2Q02521 185 aa0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B SLU7Q02775 382 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
tF(GAA)BtF(GAA)B YML131WQ03102 365 aa0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.2 ms