RNA–Protein interactions for RNA: YPR080W

TEF1, Transcript of Translational elongation factor EF-1 alpha, yeast

Gene TEF1, Length 1,377 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TEF1	YPR080W	PTC6	P25646	442 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RIB7	P33312	244 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SLC1	P33333	303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SEC66	P33754	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	CCZ1	P38273	704 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RTC2	P38279	296 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	FAA3	P39002	694 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YER184C	P39961	794 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YNL195C	P40168	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	CFD1	P40558	293 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	HXT9	P40885	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	CIN1	P40987	1014 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SAM37	P50110	327 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PAU12	P53343	120 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	NRM1	P53718	249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	HXT11	P54862	567 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RSM28	Q03430	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	COQ10	Q08058	207 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	HNT3	Q08702	217 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YDL109C	Q12103	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MCP1	Q12106	302 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SIR2	P06700	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	COX9	P07255	59 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	CAP2	P13517	287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	ERD1	P16151	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YPK2	P18961	677 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	DAL82	P21705	255 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SPT14	P32363	452 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	EMP70	P32802	667 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	VPS17	P32913	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MDL1	P33310	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	ZRT3	P34240	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MAL32	P38158	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SER2	P42941	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RPE1	P46969	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	LCL3	P53153	274 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MAL12	P53341	584 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RRN9	P53437	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YNR062C	P53748	327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	INP1	Q03694	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	DCR2	Q05924	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	GUP2	Q08929	609 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RAD51	P25454	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	DOA4	P32571	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YEF1	P32622	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SDS22	P36047	338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
TEF1	YPR080W	SRL3	P36167	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	THI2	P38141	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	CHK1	P38147	527 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PAU24	P38155	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	YHK8	P38776	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SKN7	P38889	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	FET3	P38993	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	FMC1	P40491	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	POP1	P41812	875 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	LEM3	P42838	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	SPG5	P42933	373 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PMT6	P42934	759 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	BNA6	P43619	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PMT5	P52867	743 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	TPN1	P53099	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PFA5	Q03289	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	EKI1	Q03764	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	GPN3	Q06543	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	NPC2	Q12408	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TEF1	YPR080W	PDE2	P06776	526 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	CYT1	P07143	309 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	STE12	P13574	688 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	GCN3	P14741	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	YCL002C	P25565	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TEF1	YPR080W	HYM1	P32464	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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