RNA–Protein interactions for RNA: YMR107W

SPG4, Transcript of Protein required for high temperature survival during stationary phase, yeast

Gene SPG4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPG4	YMR107W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	AKR2	Q12013	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ATX2	Q12067	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	HAP2	P06774	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	KAR1	P11927	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ERD1	P16151	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MRPL44	P19956	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	EPT1	P22140	391 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YCR101C	P25607	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YBR063C	P38083	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	NIT2	P47016	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RAD17	P48581	401 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MNT2	P53059	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	VOA1	P53262	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RHO4	Q00246	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SPG3	Q04398	127 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SPR28	Q04921	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	EAF1	Q06337	982 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YPD1	Q07688	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	THI73	Q07904	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	DDC1	Q08949	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SPC3	Q12133	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PST1	Q12355	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	STT4	P37297	1900 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	CAN1	P04817	590 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	CDC34	P14682	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	RER1	P25560	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	NTH1	P32356	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SPT10	P35208	640 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	MRPL16	P38064	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	THI2	P38141	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	LDB7	P38210	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	BMT2	P38278	337 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	HSE1	P38753	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	UBA4	P38820	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	FAA3	P39002	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YEL068C	P39977	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	NIT1	P40447	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YJR124C	P47159	448 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YJR149W	P47177	404 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YGL185C	P53100	379 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YNR062C	P53748	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	AAH1	P53909	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	PUN1	Q06991	263 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YLR046C	Q12253	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	FRE6	Q12473	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	CSR2	Q12734	1121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	NAM2	P11325	894 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SIR1	P21691	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	GPI12	P23797	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	AHC2	P25649	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SFP1	P32432	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	DOA4	P32571	926 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	ORC2	P32833	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	PAU24	P38155	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	RTC2	P38279	296 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YHR035W	P38769	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YHR177W	P38867	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	TIM17	P39515	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	SLZ1	P40167	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	ALG8	P40351	577 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YIL060W	P40519	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	VMA21	P41806	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	AIM25	P47140	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	VPS25	P47142	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YGR079W	P53249	370 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YSA1	Q01976	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	MET31	Q03081	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	VID22	Q05934	901 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	NUT2	Q06213	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	HMS1	Q12398	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	TFC7	Q12415	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	RRI1	Q12468	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SPG4	YMR107W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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