RNA–Protein interactions for RNA: YKL195W

MIA40, Transcript of Mitochondrial oxidoreductase, yeast

Gene MIA40, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MIA40	YKL195W	MCM7	P38132	845 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	VMA22	P38784	181 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ALP1	P38971	573 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YNL195C	P40168	261 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	IMO32	P53219	342 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	TPC1	P53257	314 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	DML1	Q03652	475 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PLM2	Q04383	521 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SNO4	Q04902	237 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	HSP32	Q08992	237 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	HSP42	Q12329	375 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YPR1	Q12458	312 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	GAL4	P04386	881 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ERD2	P18414	219 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	CWP1	P28319	239 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YEF1	P32622	495 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	NNK1	P36003	928 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	DTR1	P38125	572 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	IFA38	P38286	347 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ANS1	P38832	159 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	LTP1	P40347	161 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	CIN1	P40987	1014 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	MDV1	P47025	714 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	GNP1	P48813	663 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	DIE2	P50076	525 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	MRPL13	Q02204	264 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PFA5	Q03289	374 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SPC19	Q03954	165 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YML053C	Q04978	212 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	STP3	Q05937	343 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	BUR2	Q05949	395 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	BNA5	Q05979	453 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YPR196W	Q06595	470 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YLR030W	Q07967	263 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	RTN2	Q12443	393 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	KIN28	P06242	306 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	GPI12	P23797	304 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	IMG1	P25626	169 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ACH1	P32316	526 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	JEN1	P36035	616 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	not detected
MIA40	YKL195W	PHO90	P39535	881 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	HPA3	P39979	161 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SIT1	P39980	628 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ICE2	P40499	491 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YPS6	P40583	537 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	FET5	P43561	622 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SFH5	P47008	294 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ECL1	P48235	211 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	VOA1	P53262	265 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PAU12	P53343	120 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YNR062C	P53748	327 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	TPP1	Q03796	238 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	DIC1	Q06143	298 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	GUP2	Q08929	609 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	PSF1	Q12488	208 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	DFG16	Q99234	619 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MIA40	YKL195W	GCN4	P03069	281 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ERG9	P29704	444 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	DCG1	P32460	244 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	HYM1	P32464	399 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	TIM12	P32830	109 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ECT1	P33412	323 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PAU24	P38155	120 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	VPS52	P39904	641 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YKE4	P40544	346 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YGL235W	P53071	178 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YGR012W	P53206	393 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	ERV29	P53337	310 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	MFB1	Q04922	465 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YPR127W	Q06494	345 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	NPC2	Q12408	173 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	SNF5	P18480	905 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	RNP1	P32385	249 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MIA40	YKL195W	DOA4	P32571	926 aa		5.95	□□□□□ -1.46

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