RNA–Protein interactions for RNA: YLR265C

NEJ1, Transcript of Protein involved in regulation of nonhomologous end joining, yeast

Gene NEJ1, Length 1,029 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEJ1	YLR265C	INP1	Q03694	420 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RCF1	Q03713	159 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	YMR244W	Q04018	355 aa		2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	YPR096C	O13587	100 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	MAS1	P10507	462 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	MXR2	P25566	168 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RPB9	P27999	122 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RXT2	P38255	430 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	APC5	Q08683	685 aa		2.7	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	UTR1	P21373	530 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	ZRT3	P34240	503 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	BLI1	P35727	113 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	APE4	P38821	490 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	YHC3	P47040	408 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RAD1	P06777	1100 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	DAL5	P15365	543 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	RDS1	P25611	832 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	TPC1	P53257	314 aa		2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	ERG9	P29704	444 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	HMX1	P32339	317 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	SWI3	P32591	825 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	SDH4	P37298	181 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	YHR122W	P38829	231 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	HIT1	P46973	164 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	GLE1	Q12315	538 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	SKS1	Q12505	502 aa		2.67	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	SPH1	Q06160	661 aa		2.66	□□□□□ -1.98
NEJ1	YLR265C	DAD2	P36162	133 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	IML3	P38265	245 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	PEX32	P38292	413 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	ECM14	P38836	430 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MIC19	P43594	170 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	ASG7	P46993	209 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	FMP48	P53233	369 aa		2.65	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MHP1	P43638	1398 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	CTA1	P15202	515 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	RCK1	P38622	512 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	GTO3	Q04806	366 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	FRE6	Q12473	712 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	TKL2	P33315	681 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MMS21	P38632	267 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YMR134W	P40207	237 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SDS23	P53172	527 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YNL143C	P53908	130 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	EOS1	P53938	366 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YDR222W	Q04925	415 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SAG1	P20840	650 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	PPQ1	P32945	549 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YKL187C	P34231	750 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YIL054W	P40524	105 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	CAX4	P53223	239 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	NFI1	Q12216	726 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	OPI1	P21957	404 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	HXT2	P23585	541 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	DCC1	P25559	380 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.61	□□□□□ -1.99	not detected
NEJ1	YLR265C	UTR5	P32630	166 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	DSE1	P40077	573 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	PMT4	P46971	762 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	ARR1	Q06596	294 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MIM1	Q08176	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YPL264C	Q08980	353 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	REP1	P03871	373 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	STE3	P06783	470 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	DAL81	P21657	970 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	INO2	P26798	304 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	CIN8	P27895	1000 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	ITR2	P30606	609 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SLM1	P40485	686 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YGL118C	P53132	145 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YGR016W	P53209	190 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	HCH1	P53834	153 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SPT7	P35177	1332 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	MYO3	P36006	1272 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	SMF2	P38778	549 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YPR063C	Q12160	140 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NEJ1	YLR265C	YLL053C	P0CD98	152 aa		2.58	□□□□□ -2
NEJ1	YLR265C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEJ1	YLR265C	MIG1	P27705	504 aa		2.58	□□□□□ -2
NEJ1	YLR265C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
NEJ1	YLR265C	SIF2	P38262	535 aa		2.58	□□□□□ -2
NEJ1	YLR265C	CAJ1	P39101	391 aa		2.58	□□□□□ -2

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