RNA–Protein interactions for RNA: YLR224W

YLR224W, Transcript of F-box protein and component of SCF ubiquitin ligase complexes, yeast

Gene YLR224W, Length 1,110 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR224W	YLR224W	PEX18	P38855	283 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	VPS45	P38932	577 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	OSW5	P40219	148 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	AIM23	P47015	356 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	NUP84	P52891	726 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YGR015C	P53208	328 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	GIM3	P53900	129 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PIN3	Q06449	215 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	IES4	Q08561	116 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PDR10	P51533	1564 aa		2.23	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	DOP1	Q03921	1698 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	GAL7	P08431	366 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CDC42	P19073	191 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	PDC2	P32896	925 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YER184C	P39961	794 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YJR054W	P47114	497 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	CDH1	P53197	566 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	LST7	P53237	242 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SNZ1	Q03148	297 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	SMP3	Q04174	516 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	GAS2	Q06135	555 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	TRM732	Q03496	1420 aa		2.22	□□□□□ -2.05
YLR224W	YLR224W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	EPT1	P22140	391 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PMT2	P31382	759 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	KDX1	P36005	433 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	DTR1	P38125	572 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ECM34	P38728	170 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RBG1	P39729	369 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MOB2	P43563	287 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	EFM3	P47163	339 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RAD17	P48581	401 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	VEL1	P53058	206 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	LSB1	P53281	241 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YNL143C	P53908	130 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YNL050C	P53952	270 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RMI1	Q02685	241 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MRX11	Q03079	207 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SLM3	Q12093	417 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	GLE1	Q12315	538 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	APC2	Q12440	853 aa		2.21	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CKI1	P20485	582 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.2	□□□□□ -2.06	not detected
YLR224W	YLR224W	KRE6	P32486	720 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SUR1	P33300	382 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MRPL40	P36534	297 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YHR122W	P38829	231 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ATG7	P38862	630 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YNL320W	P42840	284 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	STB1	P42845	420 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YGR067C	P53243	804 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TRM82	Q03774	444 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	GGA1	Q06336	557 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	FRE8	Q12209	686 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	DNF3	Q12674	1656 aa		2.2	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	NUP170	P38181	1502 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	KSS1	P14681	368 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	VPS3	P23643	1011 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	DOA4	P32571	926 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	MRPS5	P33759	307 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	UIP5	P36137	443 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SMP1	P38128	452 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	IST2	P38250	946 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SIF2	P38262	535 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	RCK2	P38623	610 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YMR134W	P40207	237 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YIL089W	P40500	205 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YHC3	P47040	408 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SHE4	P51534	789 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CGR1	P53188	120 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	YGR266W	P53326	701 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	PRM1	P53835	661 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	AQR1	P53943	586 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	ARP5	P53946	755 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	SUR7	P54003	302 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	CSM3	Q04659	317 aa		2.19	□□□□□ -2.06
YLR224W	YLR224W	NAT4	Q04751	285 aa		2.19	□□□□□ -2.06

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.9 ms