RNA–Protein interactions for RNA: YMR071C

TVP18, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP18, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP18	YMR071C	MMP1	Q12372	583 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TVP18	YMR071C	YJL007C	P47080	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP18	YMR071C	TBF1	Q02457	562 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TVP18	YMR071C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	KIP2	P28743	706 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	YBL036C	P38197	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
TVP18	YMR071C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	ESS1	P22696	170 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	UGA3	P26370	528 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	BIM1	P40013	344 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	IXR1	P33417	597 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	RAD59	Q12223	238 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	ARG8	P18544	423 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	YJU3	P28321	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	ATG32	P40458	529 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	OPT2	Q06593	877 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	CSE4	P36012	229 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	ACO2	P39533	789 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	SRF1	Q12516	437 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TVP18	YMR071C	CAF120	P53836	1060 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	VAC17	P25591	423 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	BIO2	P32451	375 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	RSC30	P38781	883 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	NUP85	P46673	744 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	SIS2	P36024	562 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	RTT106	P40161	455 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	YNL108C	P53929	270 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	YBL086C	P38177	466 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	ITT1	Q04638	464 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TVP18	YMR071C	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	SCW11	P53189	542 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	APP1	P53933	587 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	ARG82	P07250	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	MIP1	P15801	1254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	MNN4	P36044	1178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	YIR007W	P40566	764 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	AAD14	P42884	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	CPS1	P27614	576 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	CAB3	P36076	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	TTI1	P36097	1038 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	GEF1	P37020	779 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	LSC2	P53312	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	TRK2	P28584	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	DLD1	P32891	587 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	FIG4	P42837	879 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	YPP1	P46951	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	YJR098C	P47139	656 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	YGR035C	P53222	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	HPF1	Q05164	967 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	RIM21	P48565	533 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TVP18	YMR071C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	MRX10	Q05648	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	MCM16	Q12262	181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	MKS1	P34072	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	DFG5	Q05031	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	OSH7	P38755	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	IOC4	Q04213	475 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	TEC1	P18412	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	ISF1	P32488	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	SLX8	P40072	274 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	ROG3	P43602	733 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	TOP1	P04786	769 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	GUT2	P32191	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	EMP47	P43555	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	CCP1	P00431	361 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	PUP1	P25043	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	FBP26	P32604	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	TGL4	P36165	910 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	ATG3	P40344	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TVP18	YMR071C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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