RNA–Protein interactions for RNA: YJL223C

PAU1, Transcript of Member of the seripauperin multigene family, yeast

Gene PAU1, Length 363 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAU1	YJL223C	HPC2	Q01448	625 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PAU1	YJL223C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAU1	YJL223C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PAU1	YJL223C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	TEC1	P18412	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	SRF1	Q12516	437 aa		4.71	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
PAU1	YJL223C	CSE4	P36012	229 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	YJR115W	P47152	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	ENV9	Q08651	330 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	HSL1	P34244	1518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	FIG4	P42837	879 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	YDR444W	Q04093	687 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	MET22	P32179	357 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	YBL036C	P38197	257 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	GUT2	P32191	649 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	TFB3	Q03290	321 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PAU1	YJL223C	YBL086C	P38177	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	APP1	P53933	587 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	ARG82	P07250	355 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	ECM5	Q03214	1411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	MKS1	P34072	584 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	LEO1	P38439	464 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	MRX12	P47084	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	AAD14	P42884	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	NUP85	P46673	744 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	YPP1	P46951	817 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	FRA1	Q07825	749 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	FBP26	P32604	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	RGA1	P39083	1007 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	YPL062W	Q02781	134 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	ITT1	Q04638	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	MCM16	Q12262	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	LSC2	P53312	427 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	BDS1	Q08347	646 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	MIP1	P15801	1254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	PKC1	P24583	1151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	ATG3	P40344	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	DFG5	Q05031	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	OPT2	Q06593	877 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	ATG20	Q07528	640 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PAU1	YJL223C	BIO2	P32451	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	EMP47	P43555	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	SCW11	P53189	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	HIR3	P47171	1648 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	BUD4	P47136	1447 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	UBP2	Q01476	1272 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	STE6	P12866	1290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	ISU1	Q03020	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	ISF1	P32488	338 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	DLD1	P32891	587 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	YJL007C	P47080	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	YJR098C	P47139	656 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	APL6	P46682	809 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	CAF120	P53836	1060 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	YNL108C	P53929	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	ACO2	P39533	789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PAU1	YJL223C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	UTR2	P32623	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	TBS1	P38114	1094 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	VTC4	P47075	721 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	RIM21	P48565	533 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	MDS3	P53094	1487 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	SOH1	P38633	127 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	PEP1	P32319	1579 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	BIM1	P40013	344 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	YIR007W	P40566	764 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	WTM2	Q12206	467 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	OSH7	P38755	437 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	ATG32	P40458	529 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PAU1	YJL223C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69

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