RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 KIF15Q9NS87 1388 aa34.41■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.41■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 PREX1Q8TCU6 1659 aa34.4■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.39■■■■□ 3.1
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.37■■■■□ 3.09
SYT6-210ENST00000641643 NPATQ14207 1427 aa34.36■■■■□ 3.09
SYT6-210ENST00000641643 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.33■■■■□ 3.09
SYT6-210ENST00000641643 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.33■■■■□ 3.09
SYT6-210ENST00000641643 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
SYT6-210ENST00000641643 ERBINQ96RT1 1412 aa34.3■■■■□ 3.08
SYT6-210ENST00000641643 PTPRKQ15262 1439 aa34.28■■■■□ 3.08
SYT6-210ENST00000641643 NCOA1Q15788 1441 aa34.28■■■■□ 3.08
SYT6-210ENST00000641643 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SYT6-210ENST00000641643 ADGRL2O95490 1459 aa34.22■■■■□ 3.07
SYT6-210ENST00000641643 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.19■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 PZPP20742 1482 aa34.19■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 ABCC3O15438 1527 aa34.17■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 ITGAEP38570 1179 aa34.17■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.17■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 KANK1Q14678 1352 aa34.15■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.15■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 TNRQ92752 1358 aa34.14■■■■□ 3.06
SYT6-210ENST00000641643 DMRT2Q9Y5R5 561 aa34.11■■■■□ 3.05
SYT6-210ENST00000641643 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.11■■■■□ 3.05
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa34.11■■■■□ 3.05
SYT6-210ENST00000641643 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
SYT6-210ENST00000641643 ROCK1Q13464 1354 aa34.08■■■■□ 3.05
SYT6-210ENST00000641643 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 CEP152O94986 1710 aa34.05■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 DEPDC5O75140 1603 aa34.05■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 A2ML1A8K2U0 1454 aa34.03■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.02■■■■□ 3.04
SYT6-210ENST00000641643 STRCQ7RTU9 1775 aa34.01■■■■□ 3.03
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa33.98■■■■□ 3.03
SYT6-210ENST00000641643 ERVK-7P63135 1459 aa33.97■■■■□ 3.03
SYT6-210ENST00000641643 NLRP1Q9C000 1473 aa33.97■■■■□ 3.03
SYT6-210ENST00000641643 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.96■■■■□ 3.03
SYT6-210ENST00000641643 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 PLA2R1Q13018 1463 aa33.94■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 PKD2Q13563 968 aa33.93■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa33.92■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.92■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 VWDEQ8N2E2 1590 aa33.92■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 PTPRTO14522 1441 aa33.92■■■■□ 3.02
SYT6-210ENST00000641643 UGGT1Q9NYU2 1555 aa33.88■■■■□ 3.01
SYT6-210ENST00000641643 ANKLE2Q86XL3 938 aa33.81■■■■□ 3
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.81■■■■□ 3
SYT6-210ENST00000641643 UNC13BO14795 1591 aa33.81■■■■□ 3
SYT6-210ENST00000641643 NUP155O75694 1391 aa33.79■■■■□ 3
SYT6-210ENST00000641643 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.77■■■■□ 3
SYT6-210ENST00000641643 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
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SYT6-210ENST00000641643 TET3O43151 1660 aa33.74■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 CERKQ8TCT0 537 aa33.73■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 NOS1P29475 1434 aa33.72■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 IDI1Q13907 227 aa33.72■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 NAIPQ13075 1403 aa33.71■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.71■■■□□ 2.99
SYT6-210ENST00000641643 IQGAP3Q86VI3 1631 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 FBXO41Q8TF61 875 aa33.68■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 GCC2Q8IWJ2 1684 aa33.67■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 UBR1Q8IWV7 1749 aa33.67■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 HFM1A2PYH4 1435 aa33.66■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 SYNMO15061 1565 aa33.65■■■□□ 2.98
SYT6-210ENST00000641643 PIK3C2BO00750 1634 aa33.63■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.62■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 EID1Q9Y6B2 187 aa33.62■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 TXNDC2Q86VQ3 553 aa33.6■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 MED14O60244 1454 aa33.6■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 TRIM52Q96A61 297 aa33.58■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 E9PCH4 1651 aa33.58■■■□□ 2.97
SYT6-210ENST00000641643 TMEM2Q9UHN6 1383 aa33.57■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 SLIT1O75093 1534 aa33.56■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 LTBP4Q8N2S1 1624 aa33.56■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP33.56■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP23Q9P227 1491 aa33.55■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 LTKP29376 864 aa33.55■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 ADGRB3O60242 1522 aa33.52■■■□□ 2.96
SYT6-210ENST00000641643 IQGAP1P46940 1657 aa33.51■■■□□ 2.95
SYT6-210ENST00000641643 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.51■■■□□ 2.95
SYT6-210ENST00000641643 HDGFP51858 240 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
SYT6-210ENST00000641643 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
SYT6-210ENST00000641643 IQSEC2Q5JU85 1478 aa33.41■■■□□ 2.94
SYT6-210ENST00000641643 BCANQ96GW7 911 aa33.39■■■□□ 2.94
SYT6-210ENST00000641643 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.38■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 CPS1P31327 1500 aa33.37■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa33.36■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 RIMS2Q9UQ26 1411 aa33.35■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP33.35■■■□□ 2.93
SYT6-210ENST00000641643 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.34■■■□□ 2.93
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