RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SPIN3-222	ENST00000639482	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SPIN3-222	ENST00000639482	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	PLCH2	O75038	1416 aa		13.45	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.43	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	PLIN1	O60240	522 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	IL27	Q8NEV9	243 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF3B	O15066	747 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	NEFM	P07197	916 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	USP47	Q96K76	1375 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.38	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	FANCA	O15360	1455 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	GGT6	Q6P531	493 aa		13.35	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE4A	P27815	886 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC1	P33527	1531 aa		13.34	□□□□□ -0.27
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.33	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.31	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.28	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	A2M	P01023	1474 aa		13.27	□□□□□ -0.28
SPIN3-222	ENST00000639482	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.27	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS3	P49796	1198 aa		13.26	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	KDM5C	P41229	1560 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	UNC13B	O14795	1591 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	BACH2	Q9BYV9	841 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	ARX	Q96QS3	562 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-222	ENST00000639482	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.21	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-222	ENST00000639482	ATP10A	O60312	1499 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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