RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 ADGRL2O95490 1459 aa26.12■■□□□ 1.77
CLN6-218ENST00000637223 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.09■■□□□ 1.77
CLN6-218ENST00000637223 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.09■■□□□ 1.77
CLN6-218ENST00000637223 KIF3BO15066 747 aa26.07■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 ROCK1Q13464 1354 aa26.06■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 GGT6Q6P531 493 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.05■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 ERBINQ96RT1 1412 aa26.02■■□□□ 1.76
CLN6-218ENST00000637223 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.99■■□□□ 1.75
CLN6-218ENST00000637223 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.97■■□□□ 1.75
CLN6-218ENST00000637223 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLN6-218ENST00000637223 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CLN6-218ENST00000637223 STRCQ7RTU9 1775 aa25.96■■□□□ 1.75
CLN6-218ENST00000637223 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.93■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.91■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 NAIPQ13075 1403 aa25.9■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.9■■□□□ 1.74
CLN6-218ENST00000637223 HFM1A2PYH4 1435 aa25.88■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.88■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.88■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.88■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.85■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 PTPRTO14522 1441 aa25.84■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 DEPDC5O75140 1603 aa25.83■■□□□ 1.73
CLN6-218ENST00000637223 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 ABCC3O15438 1527 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 ZMYM3Q14202 1370 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 KANK1Q14678 1352 aa25.82■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.81■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 UNC13BO14795 1591 aa25.77■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.77■■□□□ 1.72
CLN6-218ENST00000637223 MROH2AA6NES4 1674 aa25.76■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.75■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 NUP155O75694 1391 aa25.75■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 C3P01024 1663 aa25.74■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.74■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 CEP152O94986 1710 aa25.74■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.71■■□□□ 1.71
CLN6-218ENST00000637223 TRIM52Q96A61 297 aa25.7■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 PZPP20742 1482 aa25.7■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.7■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.7■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.67■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 NPATQ14207 1427 aa25.65■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.65■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.64■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.64■■□□□ 1.7
CLN6-218ENST00000637223 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.63■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 TET3O43151 1660 aa25.61■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 ERVK-7P63135 1459 aa25.6■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 TNRQ92752 1358 aa25.6■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.59■■□□□ 1.69
CLN6-218ENST00000637223 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CLN6-218ENST00000637223 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CLN6-218ENST00000637223 PKD2Q13563 968 aa25.52■■□□□ 1.68
CLN6-218ENST00000637223 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CLN6-218ENST00000637223 E9PCH4 1651 aa25.52■■□□□ 1.68
CLN6-218ENST00000637223 HRCP23327 699 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 NOS1P29475 1434 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.51■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.5■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 SYNMO15061 1565 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 NLRP1Q9C000 1473 aa25.47■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 FOXD1Q16676 465 aa25.46■■□□□ 1.67
CLN6-218ENST00000637223 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.45■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.44■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 IDI1Q13907 227 aa25.42■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 HSPA1LP34931 641 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN6-218ENST00000637223 PLA2R1Q13018 1463 aa25.39■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 PIP4K2BP78356 416 aa25.38■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.36■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.36■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 PIK3C2BO00750 1634 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 TRPM2O94759 1503 aa25.35■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CLN6-218ENST00000637223 TOM1O60784 492 aa25.31■■□□□ 1.64
CLN6-218ENST00000637223 ADGRB3O60242 1522 aa25.31■■□□□ 1.64
CLN6-218ENST00000637223 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-218ENST00000637223 CLTCL1P53675 1640 aa25.29■■□□□ 1.64
CLN6-218ENST00000637223 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.26■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CLN6-218ENST00000637223 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.23■■□□□ 1.63
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