RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIF3AQ9Y496 699 aa16.92■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.91■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 CEP164Q9UPV0 1460 aa16.9■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 PES1O00541 588 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 PKD2Q13563 968 aa16.9■□□□□ 0.3
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD4L1Q9NU39 408 aa16.89■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 ST18O60284 1047 aa16.89■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIF16BQ96L93 1317 aa16.89■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD1Q16676 465 aa16.89■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.86■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 KIF3BO15066 747 aa16.85■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 NGEFQ8N5V2 710 aa16.85■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.84■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.84■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
SLC35E2B-205ENST00000617444 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.83■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa16.81■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.81■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.81■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 GPS2Q13227 327 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 BECN2A8MW95 431 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 H3BQV1 296 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 IFFO2Q5TF58 517 aa16.8■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPM1P09493 284 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 PDE3BQ13370 1112 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 RSPH6AQ9H0K4 717 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.78■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM184AQ8NB25 1140 aa16.77■□□□□ 0.28
SLC35E2B-205ENST00000617444 VPS37DQ86XT2 251 aa16.77■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.76■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPM2P07951 284 aa16.76■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 CUX2O14529 1486 aa16.75■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUP155O75694 1391 aa16.75■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.75■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.75■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 NLRP13Q86W25 1043 aa16.74■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 RILPL2Q969X0 211 aa16.74■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.72■□□□□ 0.279e-9■■■■■ 30.5
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRAK1Q9UPV9 953 aa16.72■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 VSIG10Q8N0Z9 540 aa16.71■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.71■□□□□ 0.27
SLC35E2B-205ENST00000617444 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 APPP05067 770 aa16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 TEFQ10587 303 aa16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.7■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF592Q92610 1267 aa16.69■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 GSE1Q14687 1217 aa16.69■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 FAM161AQ3B820 660 aa16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 MCTP1Q6DN14 999 aa16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 COG3Q96JB2 828 aa16.68■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.67■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 305.2
SLC35E2B-205ENST00000617444 PHLDB1Q86UU1 1377 aa16.67■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa16.67■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.66■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 NECTIN2Q92692 538 aa16.66■□□□□ 0.26
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRIM29Q14134 588 aa16.65■□□□□ 0.26
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