RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607519.1

GMDS-AS1-216, humanhuman

TSL 4

Gene GMDS-AS1, Length 579 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-216ENST00000607519 BCORL1Q5H9F3 1711 aa15.74■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERBINQ96RT1 1412 aa15.73■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.72■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADAMTSL3P82987 1691 aa15.7■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRIM52Q96A61 297 aa15.7■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa15.69■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.69■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MADDQ8WXG6 1647 aa15.69■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.69■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.69■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUP155O75694 1391 aa15.68■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa15.64■□□□□ 0.1
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.64■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DEPDC5O75140 1603 aa15.64■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ABCC3O15438 1527 aa15.63■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZMYM3Q14202 1370 aa15.63■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEP152O94986 1710 aa15.63■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KANK1Q14678 1352 aa15.62■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FOXD1Q16676 465 aa15.62■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UNC13BO14795 1591 aa15.62■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTPRMP28827 1452 aa15.61■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.61■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MPHOSPH9Q99550 1183 aa15.59■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PZPP20742 1482 aa15.59■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM5DQ9BY66 1539 aa15.58■□□□□ 0.09
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PKD2Q13563 968 aa15.58■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 FAM135AQ9P2D6 1515 aa15.58■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HRCP23327 699 aa15.57■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.57■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 C3P01024 1663 aa15.57■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.56■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa15.55■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LMTK2Q8IWU2 1503 aa15.54■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NPATQ14207 1427 aa15.54■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MROH2AA6NES4 1674 aa15.52■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 E9PCH4 1651 aa15.52■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TET3O43151 1660 aa15.52■□□□□ 0.08
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 EFCAB6Q5THR3 1501 aa15.51■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa15.5■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ERVK-7P63135 1459 aa15.49■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TNRQ92752 1358 aa15.49■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PLA2R1Q13018 1463 aa15.48■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 IDI1Q13907 227 aa15.48■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PREX1Q8TCU6 1659 aa15.47■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NOS1P29475 1434 aa15.46■□□□□ 0.07
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UGGT1Q9NYU2 1555 aa15.45■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SYNMO15061 1565 aa15.45■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 HSPA2P54652 639 aa15.44■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa15.44■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PTPRTO14522 1441 aa15.43■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CHGAP10645 457 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa15.41■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.41■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15.4■□□□□ 0.06
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SLC52A1Q9NWF4 448 aa15.38■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 PIK3C2BO00750 1634 aa15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CLTCL1P53675 1640 aa15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.37■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LMTK3Q96Q04 1460 aa15.36■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NEUROD1Q13562 356 aa15.36■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.36■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.35■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TRPM2O94759 1503 aa15.35■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RGL3Q3MIN7 710 aa15.35■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NLRP1Q9C000 1473 aa15.34■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.34■□□□□ 0.05
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 LTKP29376 864 aa15.32■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.32■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 UBR1Q8IWV7 1749 aa15.31■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.31■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.29■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KIF1BO60333 1816 aa15.29■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 ADGRB3O60242 1522 aa15.28■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.27■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.27■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.27■□□□□ 0.04
GMDS-AS1-216ENST00000607519 RIMS2Q9UQ26 1411 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms