RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MLECQ14165 292 aa23.49■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UNC13BO14795 1591 aa23.48■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GGT6Q6P531 493 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.47■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.45■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP152O94986 1710 aa23.43■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MADDQ8WXG6 1647 aa23.4■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KANK1Q14678 1352 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.38■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM52Q96A61 297 aa23.37■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ABCC3O15438 1527 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NUP155O75694 1391 aa23.36■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.35■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.34■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MROH2AA6NES4 1674 aa23.32■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.32■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TET3O43151 1660 aa23.32■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HRCP23327 699 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PZPP20742 1482 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.3■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C3P01024 1663 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 E9PCH4 1651 aa23.26■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZMYM3Q14202 1370 aa23.22■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.21■■□□□ 1.31
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPRMP28827 1452 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NPATQ14207 1427 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.2■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PKD2Q13563 968 aa23.17■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.16■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FOXD1Q16676 465 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERVK-7P63135 1459 aa23.13■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.11■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SYNMO15061 1565 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NOS1P29475 1434 aa23.08■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRPM2O94759 1503 aa23.06■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TNRQ92752 1358 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPRTO14522 1441 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLA2R1Q13018 1463 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLTCL1P53675 1640 aa23.03■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PIK3C2BO00750 1634 aa23.02■■□□□ 1.28
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF1BO60333 1816 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NLRP1Q9C000 1473 aa22.97■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.96■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IDI1Q13907 227 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.93■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ADGRB3O60242 1522 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.92■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.91■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.87■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.85■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NEUROD1Q13562 356 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RGL3Q3MIN7 710 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IFT172Q9UG01 1749 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPLO60437 1756 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.76■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HSPA2P54652 639 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLIT1O75093 1534 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms