RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583282.5

GGA3-216, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-216ENST00000583282 KIF3BO15066 747 aa21.17■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 CEP152O94986 1710 aa21.17■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 HFM1A2PYH4 1435 aa21.16■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 NAIPQ13075 1403 aa21.16■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 UNC13BO14795 1591 aa21.15■□□□□ 0.98
GGA3-216ENST00000583282 GGT6Q6P531 493 aa21.14■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.13■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 ABCC3O15438 1527 aa21.09■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 MROH2AA6NES4 1674 aa21.09■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.08■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.08■□□□□ 0.97
GGA3-216ENST00000583282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.08■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.07■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 C3P01024 1663 aa21.07■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.05■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.05■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.05■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.04■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 PTPRMP28827 1452 aa21.04■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 KANK1Q14678 1352 aa21.03■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.03■□□□□ 0.96
GGA3-216ENST00000583282 TET3O43151 1660 aa21.01■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.98■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 NUP155O75694 1391 aa20.97■□□□□ 0.95
GGA3-216ENST00000583282 E9PCH4 1651 aa20.95■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.94■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 TRIM52Q96A61 297 aa20.94■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.94■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 PZPP20742 1482 aa20.94■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 ZMYM3Q14202 1370 aa20.93■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 NPATQ14207 1427 aa20.91■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 MYO3AQ8NEV4 1616 aa20.9■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 ERVK-7P63135 1459 aa20.89■□□□□ 0.94
GGA3-216ENST00000583282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.88■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.87■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.87■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa20.86■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 SYNMO15061 1565 aa20.85■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
GGA3-216ENST00000583282 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 TNRQ92752 1358 aa20.82■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.8■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.78■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 NOS1P29475 1434 aa20.78■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 PKD2Q13563 968 aa20.77■□□□□ 0.92
GGA3-216ENST00000583282 PIK3C2BO00750 1634 aa20.76■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 TRPM2O94759 1503 aa20.76■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 CLTCL1P53675 1640 aa20.75■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 FOXD1Q16676 465 aa20.75■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.75■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 LMTK3Q96Q04 1460 aa20.75■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 NLRP1Q9C000 1473 aa20.73■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 HRCP23327 699 aa20.72■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.71■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 UBR1Q8IWV7 1749 aa20.71■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 ADGRB3O60242 1522 aa20.71■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 MYO5BQ9ULV0 1848 aa20.71■□□□□ 0.91
GGA3-216ENST00000583282 PTPRTO14522 1441 aa20.69■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 PLA2R1Q13018 1463 aa20.69■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 KIF1BO60333 1816 aa20.66■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa20.64■□□□□ 0.9
GGA3-216ENST00000583282 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.63■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 HSPA2P54652 639 aa20.63■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 IDI1Q13907 227 aa20.61■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.6■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.59■□□□□ 0.89
GGA3-216ENST00000583282 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.58■□□□□ 0.88
GGA3-216ENST00000583282 STRCQ7RTU9 1775 aa20.54■□□□□ 0.88
GGA3-216ENST00000583282 SLIT1O75093 1534 aa20.53■□□□□ 0.88
GGA3-216ENST00000583282 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.52■□□□□ 0.88
GGA3-216ENST00000583282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.51■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.51■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 IFT172Q9UG01 1749 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 PPLO60437 1756 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 ZFYVE9O95405 1425 aa20.48■□□□□ 0.87
GGA3-216ENST00000583282 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms