RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.85■■■■■ 4.13
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CTDNEP1-210ENST00000574322 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.8■■■■■ 4.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAGI2Q86UL8 1455 aa40.79■■■■■ 4.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.78■■■■■ 4.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP7AQ04656 1500 aa40.75■■■■■ 4.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 YEATS2Q9ULM3 1422 aa40.74■■■■■ 4.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.73■■■■■ 4.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.71■■■■■ 4.11
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CTDNEP1-210ENST00000574322 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.61■■■■■ 4.09
CTDNEP1-210ENST00000574322 ATP10AO60312 1499 aa40.59■■■■■ 4.09
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2R1Q13018 1463 aa40.42■■■■■ 4.06
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.34■■■■■ 4.05
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TET3O43151 1660 aa40.33■■■■■ 4.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGLP35573 1532 aa40.33■■■■■ 4.05
CTDNEP1-210ENST00000574322 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.33■■■■■ 4.05
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.31■■■■■ 4.04
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GGT6Q6P531 493 aa40.22■■■■■ 4.03
CTDNEP1-210ENST00000574322 PTPRTO14522 1441 aa40.22■■■■■ 4.03
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRPM2O94759 1503 aa40.19■■■■■ 4.02
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CTDNEP1-210ENST00000574322 KIF7Q2M1P5 1343 aa39.69■■■■□ 3.94
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADGRB3O60242 1522 aa39.66■■■■□ 3.94
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ANP32CO43423 234 aa39.62■■■■□ 3.93
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