RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 DEPDC5O75140 1603 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 A2MP01023 1474 aa25.78■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
HERC2-208ENST00000566635 PKD2Q13563 968 aa25.75■■□□□ 1.71
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.74■■□□□ 1.71
HERC2-208ENST00000566635 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.74■■□□□ 1.71
HERC2-208ENST00000566635 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.73■■□□□ 1.71
HERC2-208ENST00000566635 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
HERC2-208ENST00000566635 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 KIF3BO15066 747 aa25.69■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.67■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.67■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 TONSLQ96HA7 1378 aa25.65■■□□□ 1.7
HERC2-208ENST00000566635 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 E9PCH4 1651 aa25.61■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 TET3O43151 1660 aa25.61■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.6■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 KANK1Q14678 1352 aa25.6■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 CEP152O94986 1710 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.59■■□□□ 1.69
HERC2-208ENST00000566635 ATP10AO60312 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 REREQ9P2R6 1566 aa25.55■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.54■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 PLA2R1Q13018 1463 aa25.54■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 GGT6Q6P531 493 aa25.53■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.52■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.52■■□□□ 1.68
HERC2-208ENST00000566635 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.5■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 ABCC3O15438 1527 aa25.49■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.47■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.47■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 AGLP35573 1532 aa25.46■■□□□ 1.67
HERC2-208ENST00000566635 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 TRPM2O94759 1503 aa25.45■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 PTPRTO14522 1441 aa25.42■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.41■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 CLTCL1P53675 1640 aa25.4■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 NPATQ14207 1427 aa25.39■■□□□ 1.66
HERC2-208ENST00000566635 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.35■■□□□ 1.65
HERC2-208ENST00000566635 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HERC2-208ENST00000566635 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HERC2-208ENST00000566635 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 MLECQ14165 292 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.3■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.29■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.29■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 RGL3Q3MIN7 710 aa25.27■■□□□ 1.64
HERC2-208ENST00000566635 SYNMO15061 1565 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.26■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.25■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 NOS1P29475 1434 aa25.25■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 KIF1BO60333 1816 aa25.24■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 MROH2AA6NES4 1674 aa25.24■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.24■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.23■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.22■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.21■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 PIK3C2BO00750 1634 aa25.21■■□□□ 1.63
HERC2-208ENST00000566635 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.19■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 ADGRB3O60242 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.16■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 ERVK-7P63135 1459 aa25.16■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.15■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HERC2-208ENST00000566635 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.13■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 IFT172Q9UG01 1749 aa25.13■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 MADDQ8WXG6 1647 aa25.12■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.11■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.08■■□□□ 1.61
HERC2-208ENST00000566635 ZMYM3Q14202 1370 aa25.08■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.06■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 PPLO60437 1756 aa25.05■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 IDI1Q13907 227 aa25.05■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 MYOM2P54296 1465 aa25.04■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.04■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.03■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HERC2-208ENST00000566635 USP47Q96K76 1375 aa25■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 C3P01024 1663 aa25■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.99■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.98■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.98■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 LAMC1P11047 1609 aa24.97■■□□□ 1.59
HERC2-208ENST00000566635 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.97■■□□□ 1.59
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