RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559271.1

RPUSD2-202, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD2, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2-202ENST00000559271 NUP155O75694 1391 aa28.79■■■□□ 2.2
RPUSD2-202ENST00000559271 DEPDC5O75140 1603 aa28.77■■■□□ 2.2
RPUSD2-202ENST00000559271 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
RPUSD2-202ENST00000559271 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.76■■■□□ 2.19
RPUSD2-202ENST00000559271 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.75■■■□□ 2.19
RPUSD2-202ENST00000559271 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.71■■■□□ 2.19
RPUSD2-202ENST00000559271 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.71■■■□□ 2.19
RPUSD2-202ENST00000559271 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.67■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.65■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 KIF3BO15066 747 aa28.65■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.65■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 REREQ9P2R6 1566 aa28.64■■■□□ 2.18
RPUSD2-202ENST00000559271 PKD2Q13563 968 aa28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.63■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 FOXD1Q16676 465 aa28.62■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.62■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 ATP10AO60312 1499 aa28.61■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 KANK1Q14678 1352 aa28.61■■■□□ 2.17
RPUSD2-202ENST00000559271 TET3O43151 1660 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 NEUROD1Q13562 356 aa28.57■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.54■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 AGLP35573 1532 aa28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.53■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
RPUSD2-202ENST00000559271 E9PCH4 1651 aa28.5■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 CEP152O94986 1710 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 TONSLQ96HA7 1378 aa28.49■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.48■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 ABCC3O15438 1527 aa28.45■■■□□ 2.15
RPUSD2-202ENST00000559271 GGT6Q6P531 493 aa28.45■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.45■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.44■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 PLA2R1Q13018 1463 aa28.41■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.4■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.39■■■□□ 2.14
RPUSD2-202ENST00000559271 TRPM2O94759 1503 aa28.39■■■□□ 2.13
RPUSD2-202ENST00000559271 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.38■■■□□ 2.13
RPUSD2-202ENST00000559271 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
RPUSD2-202ENST00000559271 PTPRTO14522 1441 aa28.36■■■□□ 2.13
RPUSD2-202ENST00000559271 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.36■■■□□ 2.13
RPUSD2-202ENST00000559271 NPATQ14207 1427 aa28.31■■■□□ 2.12
RPUSD2-202ENST00000559271 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.3■■■□□ 2.12
RPUSD2-202ENST00000559271 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
RPUSD2-202ENST00000559271 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.29■■■□□ 2.12
RPUSD2-202ENST00000559271 CLTCL1P53675 1640 aa28.26■■■□□ 2.12
RPUSD2-202ENST00000559271 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.26■■■□□ 2.11
RPUSD2-202ENST00000559271 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
RPUSD2-202ENST00000559271 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
RPUSD2-202ENST00000559271 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.23■■■□□ 2.11
RPUSD2-202ENST00000559271 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 NOS1P29475 1434 aa28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 MLECQ14165 292 aa28.19■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.17■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.16■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 SYNMO15061 1565 aa28.15■■■□□ 2.1
RPUSD2-202ENST00000559271 PIK3C2BO00750 1634 aa28.13■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 MADDQ8WXG6 1647 aa28.12■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 KIF1BO60333 1816 aa28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 ERVK-7P63135 1459 aa28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 MROH2AA6NES4 1674 aa28.11■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 ADGRB3O60242 1522 aa28.08■■■□□ 2.09
RPUSD2-202ENST00000559271 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.07■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 RGL3Q3MIN7 710 aa28.06■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.05■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.03■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.03■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 ZMYM3Q14202 1370 aa28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 PTPRMP28827 1452 aa28.02■■■□□ 2.08
RPUSD2-202ENST00000559271 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.99■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.98■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 IFT172Q9UG01 1749 aa27.97■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 STAC3Q96MF2 364 aa27.95■■■□□ 2.07
RPUSD2-202ENST00000559271 MYOM2P54296 1465 aa27.94■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.93■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 IDI1Q13907 227 aa27.92■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 C3P01024 1663 aa27.92■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.92■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 PPLO60437 1756 aa27.9■■■□□ 2.06
RPUSD2-202ENST00000559271 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.89■■■□□ 2.05
RPUSD2-202ENST00000559271 TNRQ92752 1358 aa27.88■■■□□ 2.05
RPUSD2-202ENST00000559271 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa27.87■■■□□ 2.05
RPUSD2-202ENST00000559271 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.85■■■□□ 2.05
RPUSD2-202ENST00000559271 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.84■■■□□ 2.05
RPUSD2-202ENST00000559271 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms