RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557434.5

LGMN-216, Transcript of legumain, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LGMN, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMN-216ENST00000557434 TRIM52Q96A61 297 aa25.69■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.69■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 ATP10AO60312 1499 aa25.66■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 REREQ9P2R6 1566 aa25.65■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
LGMN-216ENST00000557434 NUP155O75694 1391 aa25.64■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.63■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 KIF3BO15066 747 aa25.62■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.62■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.61■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.61■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
LGMN-216ENST00000557434 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
LGMN-216ENST00000557434 AGLP35573 1532 aa25.56■■□□□ 1.68
LGMN-216ENST00000557434 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
LGMN-216ENST00000557434 FOXD1Q16676 465 aa25.55■■□□□ 1.68
LGMN-216ENST00000557434 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.53■■□□□ 1.68
LGMN-216ENST00000557434 CEP152O94986 1710 aa25.51■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 PKD2Q13563 968 aa25.49■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 GGT6Q6P531 493 aa25.48■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 E9PCH4 1651 aa25.47■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 TET3O43151 1660 aa25.47■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.46■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.46■■□□□ 1.67
LGMN-216ENST00000557434 ABCC3O15438 1527 aa25.45■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.45■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 KANK1Q14678 1352 aa25.43■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.42■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 PLA2R1Q13018 1463 aa25.4■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
LGMN-216ENST00000557434 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.38■■□□□ 1.65
LGMN-216ENST00000557434 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.35■■□□□ 1.65
LGMN-216ENST00000557434 MLECQ14165 292 aa25.34■■□□□ 1.65
LGMN-216ENST00000557434 NPATQ14207 1427 aa25.34■■□□□ 1.65
LGMN-216ENST00000557434 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
LGMN-216ENST00000557434 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.33■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 NEUROD1Q13562 356 aa25.32■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 PTPRTO14522 1441 aa25.31■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.28■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.28■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 TRPM2O94759 1503 aa25.27■■□□□ 1.64
LGMN-216ENST00000557434 CLTCL1P53675 1640 aa25.23■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.23■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.22■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 NOS1P29475 1434 aa25.21■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.21■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 SYNMO15061 1565 aa25.21■■□□□ 1.63
LGMN-216ENST00000557434 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.2■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 MROH2AA6NES4 1674 aa25.18■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 ZMYM3Q14202 1370 aa25.16■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.16■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.16■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 PIK3C2BO00750 1634 aa25.15■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 MADDQ8WXG6 1647 aa25.15■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 ERVK-7P63135 1459 aa25.15■■□□□ 1.62
LGMN-216ENST00000557434 TONSLQ96HA7 1378 aa25.14■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.13■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.13■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 C3P01024 1663 aa25.12■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.12■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.12■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LGMN-216ENST00000557434 KIF1BO60333 1816 aa25.08■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.05■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 ADGRB3O60242 1522 aa25.05■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 IDI1Q13907 227 aa25.03■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.02■■□□□ 1.6
LGMN-216ENST00000557434 RGL3Q3MIN7 710 aa25.01■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.98■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 IFT172Q9UG01 1749 aa24.98■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.96■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 TNRQ92752 1358 aa24.96■■□□□ 1.59
LGMN-216ENST00000557434 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.95■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.92■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 PPLO60437 1756 aa24.92■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.9■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.9■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 PTPRMP28827 1452 aa24.89■■□□□ 1.58
LGMN-216ENST00000557434 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.89■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.89■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.89■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.88■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.87■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 NLRP1Q9C000 1473 aa24.86■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 MYOM2P54296 1465 aa24.85■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.84■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.83■■□□□ 1.57
LGMN-216ENST00000557434 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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