RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551632.1

DTX3-208, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 3, human

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene DTX3, Length 1,840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DTX3-208	ENST00000551632	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.89	■■■□□ 2.38
DTX3-208	ENST00000551632	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	29.89	■■■□□ 2.37
DTX3-208	ENST00000551632	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.87	■■■□□ 2.37
DTX3-208	ENST00000551632	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.87	■■■□□ 2.37
DTX3-208	ENST00000551632	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
DTX3-208	ENST00000551632	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		29.85	■■■□□ 2.37
DTX3-208	ENST00000551632	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	FOXD1	Q16676	465 aa		29.82	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		29.81	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.8	■■■□□ 2.36	8e-7	■■■■□ 21.6
DTX3-208	ENST00000551632	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.8	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	KIF3B	O15066	747 aa		29.78	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	PKD2	Q13563	968 aa		29.78	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		29.77	■■■□□ 2.36
DTX3-208	ENST00000551632	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.75	■■■□□ 2.35
DTX3-208	ENST00000551632	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.75	■■■□□ 2.35
DTX3-208	ENST00000551632	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		29.72	■■■□□ 2.35
DTX3-208	ENST00000551632	ATP10A	O60312	1499 aa		29.7	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632	RERE	Q9P2R6	1566 aa		29.7	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632	TET3	O43151	1660 aa		29.68	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632	KANK1	Q14678	1352 aa		29.68	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632		E9PCH4	1651 aa		29.65	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632	CEP152	O94986	1710 aa		29.65	■■■□□ 2.34
DTX3-208	ENST00000551632	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.63	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		29.62	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		29.61	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.6	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	AGL	P35573	1532 aa		29.6	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	TONSL	Q96HA7	1378 aa		29.59	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	GGT6	Q6P531	493 aa		29.59	■■■□□ 2.33
DTX3-208	ENST00000551632	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.57	■■■□□ 2.32
DTX3-208	ENST00000551632	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.55	■■■□□ 2.32
DTX3-208	ENST00000551632	ABCC3	O15438	1527 aa		29.55	■■■□□ 2.32
DTX3-208	ENST00000551632	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.53	■■■□□ 2.32
DTX3-208	ENST00000551632	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		29.53	■■■□□ 2.32
DTX3-208	ENST00000551632	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.5	■■■□□ 2.31
DTX3-208	ENST00000551632	TRPM2	O94759	1503 aa		29.47	■■■□□ 2.31
DTX3-208	ENST00000551632	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		29.47	■■■□□ 2.31
DTX3-208	ENST00000551632	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.47	■■■□□ 2.31
DTX3-208	ENST00000551632	PTPRT	O14522	1441 aa		29.46	■■■□□ 2.31
DTX3-208	ENST00000551632	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.3
DTX3-208	ENST00000551632	NPAT	Q14207	1427 aa		29.42	■■■□□ 2.3
DTX3-208	ENST00000551632	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.41	■■■□□ 2.3
DTX3-208	ENST00000551632	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
DTX3-208	ENST00000551632	CLTCL1	P53675	1640 aa		29.39	■■■□□ 2.29
DTX3-208	ENST00000551632	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.36	■■■□□ 2.29
DTX3-208	ENST00000551632	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
DTX3-208	ENST00000551632	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		29.35	■■■□□ 2.29
DTX3-208	ENST00000551632	MLEC	Q14165	292 aa		29.33	■■■□□ 2.29
DTX3-208	ENST00000551632	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.31	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	29.3	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		29.29	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	NOS1	P29475	1434 aa		29.29	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		29.28	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		29.27	■■■□□ 2.28
DTX3-208	ENST00000551632	KIF1B	O60333	1816 aa		29.26	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	SYNM	O15061	1565 aa		29.26	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.22	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	RGL3	Q3MIN7	710 aa		29.21	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	MROH2A	A6NES4	1674 aa		29.2	■■■□□ 2.27
DTX3-208	ENST00000551632	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		29.2	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.18	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.18	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		29.17	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	ADGRB3	O60242	1522 aa		29.15	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.14	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		29.14	■■■□□ 2.26
DTX3-208	ENST00000551632	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		29.13	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	ZMYM3	Q14202	1370 aa		29.13	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	IFT172	Q9UG01	1749 aa		29.1	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		29.09	■■■□□ 2.25
DTX3-208	ENST00000551632	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		29.06	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		29.06	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		29.05	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		29.05	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	IDI1	Q13907	227 aa		29.04	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	MADD	Q8WXG6	1647 aa		29.04	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	C3	P01024	1663 aa		29.03	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		29.02	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	PPL	O60437	1756 aa		29.02	■■■□□ 2.24
DTX3-208	ENST00000551632	MYOM2	P54296	1465 aa		29	■■■□□ 2.23
DTX3-208	ENST00000551632	STAC3	Q96MF2	364 aa		28.99	■■■□□ 2.23
DTX3-208	ENST00000551632	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		28.97	■■■□□ 2.23
DTX3-208	ENST00000551632	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.23
DTX3-208	ENST00000551632	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		28.94	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	TNR	Q92752	1358 aa		28.94	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		28.92	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		28.91	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22
DTX3-208	ENST00000551632	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms