RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-225ENST00000551253 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 IQGAP1P46940 1657 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 ABCC1P33527 1531 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 PHLPP1O60346 1717 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 FGD6Q6ZV73 1430 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 AFF2P51816 1311 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-225ENST00000551253 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 TNRQ92752 1358 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 MYO5CQ9NQX4 1742 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 NGLY1Q96IV0 654 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 GGT6Q6P531 493 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 SLAIN2Q9P270 581 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 UGGT1Q9NYU2 1555 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 TMEM94Q12767 1356 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.27□□□□□ -0.44
CS-225ENST00000551253 HRCP23327 699 aa12.27□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 C1QTNF8P60827 252 aa12.26□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 NLRP1Q9C000 1473 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 ATP7AQ04656 1500 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 SAMD9Q5K651 1589 aa12.25□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 NWD1Q149M9 1564 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 SHPRHQ149N8 1683 aa12.24□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 MIA2Q96PC5 1412 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-225ENST00000551253 MAP3K1Q13233 1512 aa12.21□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP12.2□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 C8orf37Q96NL8 207 aa12.2□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.19□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 MSH6P52701 1360 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 EP400Q96L91 3159 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 SLC34A2O95436 690 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 KCNA6P17658 529 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 A2MP01023 1474 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 PZPP20742 1482 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 KIF14Q15058 1648 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 PLXNC1O60486 1568 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-225ENST00000551253 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 LTKP29376 864 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 TXNDC2Q86VQ3 553 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 ABCC3O15438 1527 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 PRXQ9BXM0 1461 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 DIP2AQ14689 1571 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 TIAM1Q13009 1591 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 USP21Q9UK80 565 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-225ENST00000551253 EID1Q9Y6B2 187 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 ARHGAP23Q9P227 1491 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 NCOA2Q15596 1464 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 SLIT1O75093 1534 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 PREX2Q70Z35 1606 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 ATRNO75882 1429 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 CLIP1P30622 1438 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 CEP350Q5VT06 3117 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 ADAMTS2O95450 1211 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CS-225ENST00000551253 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.02□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 UBR1Q8IWV7 1749 aa12.01□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 ADGBQ8N7X0 1667 aa12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 KIF3BO15066 747 aa12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 BRINP3Q76B58 766 aa12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 SLC26A8Q96RN1 970 aa12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 BAG6P46379 1132 aa11.99□□□□□ -0.49
CS-225ENST00000551253 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.99□□□□□ -0.49
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