RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540264.2

NFE2-203, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2, Length 1,833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-203ENST00000540264 KDM5CP41229 1560 aa22.28■■□□□ 1.16
NFE2-203ENST00000540264 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
NFE2-203ENST00000540264 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
NFE2-203ENST00000540264 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE2-203ENST00000540264 GLI2P10070 1586 aa22.27■■□□□ 1.16
NFE2-203ENST00000540264 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.26■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.25■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.25■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.24■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.23■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.22■■□□□ 1.15
NFE2-203ENST00000540264 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.2■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 KANK1Q14678 1352 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.19■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 A2MP01023 1474 aa22.18■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 KIF3BO15066 747 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 TET3O43151 1660 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 E9PCH4 1651 aa22.17■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.16■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 PTPRTO14522 1441 aa22.15■■□□□ 1.14
NFE2-203ENST00000540264 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.13■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 DIP2BQ9P265 1576 aa22.13■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 TRPM2O94759 1503 aa22.12■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.12■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.11■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.11■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.1■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 RICTORQ6R327 1708 aa22.09■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 ABCA6Q8N139 1617 aa22.09■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.08■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.08■■□□□ 1.13
NFE2-203ENST00000540264 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.08■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 RAPGEF3O95398 923 aa22.08■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.08■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 USP47Q96K76 1375 aa22.06■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 CCDC7Q96M83 1385 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.05■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 RGL3Q3MIN7 710 aa22.04■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.03■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.02■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 ANP32CO43423 234 aa22.02■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.02■■□□□ 1.12
NFE2-203ENST00000540264 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 CEP152O94986 1710 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 CLTCL1P53675 1640 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 STAC3Q96MF2 364 aa22.01■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.99■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 CCER2I3L3R5 266 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.98■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 LAMC1P11047 1609 aa21.97■■□□□ 1.11
NFE2-203ENST00000540264 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.94■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 ABCC3O15438 1527 aa21.94■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 GGT6Q6P531 493 aa21.94■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 NPATQ14207 1427 aa21.92■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.9■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 TSPOAP1O95153 1857 aa21.9■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.9■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 MADDQ8WXG6 1647 aa21.89■■□□□ 1.1
NFE2-203ENST00000540264 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.89■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.88■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.87■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.87■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.86■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 REREQ9P2R6 1566 aa21.86■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 KIF1BO60333 1816 aa21.86■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 MYOM2P54296 1465 aa21.84■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 NOS1P29475 1434 aa21.83■■□□□ 1.09
NFE2-203ENST00000540264 ADGRB3O60242 1522 aa21.82■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 AGLP35573 1532 aa21.81■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.8■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 IFT172Q9UG01 1749 aa21.79■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 MROH2AA6NES4 1674 aa21.78■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.78■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.77■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
NFE2-203ENST00000540264 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.77■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 PIK3C2BO00750 1634 aa21.76■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 TESK2Q96S53 571 aa21.76■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 IQGAP1P46940 1657 aa21.75■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.74■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 SYNMO15061 1565 aa21.74■■□□□ 1.07
NFE2-203ENST00000540264 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 101.7 ms