RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	ATP10A	O60312	1499 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	AFAP1	Q8N556	730 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	MAP3K1	Q13233	1512 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	NCOA2	Q15596	1464 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	PTPRM	P28827	1452 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	RERE	Q9P2R6	1566 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	MADD	Q8WXG6	1647 aa		10.77	□□□□□ -0.68
ACER3-213	ENST00000533873	MLEC	Q14165	292 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69	1e-6	■■■■■ 27.5
ACER3-213	ENST00000533873	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	ATP7A	Q04656	1500 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	CLCN6	P51797	869 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	PHF12	Q96QT6	1004 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	ABCA6	Q8N139	1617 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	AGL	P35573	1532 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		10.74	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	MIA2	Q96PC5	1412 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	A2M	P01023	1474 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	NUBP1	P53384	320 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	MBD5	Q9P267	1494 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ACER3-213	ENST00000533873	TSPY4	P0CV99	314 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	TSPY10	P0CW01	314 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	PLXNC1	O60486	1568 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	KLHL34	Q8N239	644 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ACER3-213	ENST00000533873	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	POTEI	P0CG38	1075 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	GGT6	Q6P531	493 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	NPAT	Q14207	1427 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	KIF3B	O15066	747 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	MROH2A	A6NES4	1674 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	ZMYM3	Q14202	1370 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	KIF15	Q9NS87	1388 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ACER3-213	ENST00000533873	DAPK1	P53355	1430 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	C3	P01024	1663 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	HSPA2	P54652	639 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	ABCC5	O15440	1437 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	MAP3K13	O43283	966 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ACER3-213	ENST00000533873	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72

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