RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PUF60-222	ENST00000533362	PTPRM	P28827	1452 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PUF60-222	ENST00000533362	GGT6	Q6P531	493 aa		34.04	■■■■□ 3.04
PUF60-222	ENST00000533362	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
PUF60-222	ENST00000533362	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.97	■■■■□ 3.03
PUF60-222	ENST00000533362	MROH2A	A6NES4	1674 aa		33.95	■■■■□ 3.03
PUF60-222	ENST00000533362	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.94	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.9	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.89	■■■■□ 3.02
PUF60-222	ENST00000533362	KANK1	Q14678	1352 aa		33.87	■■■■□ 3.01
PUF60-222	ENST00000533362	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.86	■■■■□ 3.01
PUF60-222	ENST00000533362	C3	P01024	1663 aa		33.84	■■■■□ 3.01
PUF60-222	ENST00000533362	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.83	■■■■□ 3.01
PUF60-222	ENST00000533362	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.82	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.82	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	ABCC3	O15438	1527 aa		33.81	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.79	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	NAIP	Q13075	1403 aa		33.79	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.78	■■■■□ 3	7e-7	■□□□□ 9.1
PUF60-222	ENST00000533362	UNC13B	O14795	1591 aa		33.77	■■■■□ 3
PUF60-222	ENST00000533362	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	33.75	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	NPAT	Q14207	1427 aa		33.75	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.74	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	PZP	P20742	1482 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	CEP152	O94986	1710 aa		33.73	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.71	■■■□□ 2.99
PUF60-222	ENST00000533362	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
PUF60-222	ENST00000533362	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PUF60-222	ENST00000533362	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PUF60-222	ENST00000533362	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	NUP155	O75694	1391 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	TET3	O43151	1660 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PUF60-222	ENST00000533362	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	TNR	Q92752	1358 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.56	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM52	Q96A61	297 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PUF60-222	ENST00000533362	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
PUF60-222	ENST00000533362	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362		E9PCH4	1651 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.41	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	NOS1	P29475	1434 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	33.39	■■■□□ 2.94
PUF60-222	ENST00000533362	HRC	P23327	699 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PUF60-222	ENST00000533362	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	33.35	■■■□□ 2.93
PUF60-222	ENST00000533362	SYNM	O15061	1565 aa		33.33	■■■□□ 2.93
PUF60-222	ENST00000533362	HSPA2	P54652	639 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.32	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	PKD2	Q13563	968 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		33.27	■■■□□ 2.92
PUF60-222	ENST00000533362	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	PTPRT	O14522	1441 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	IDI1	Q13907	227 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	TRPM2	O94759	1503 aa		33.2	■■■□□ 2.91
PUF60-222	ENST00000533362	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PUF60-222	ENST00000533362	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PUF60-222	ENST00000533362	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PUF60-222	ENST00000533362	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PUF60-222	ENST00000533362	SLIT1	O75093	1534 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PUF60-222	ENST00000533362	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
PUF60-222	ENST00000533362	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	CLTCL1	P53675	1640 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	FOXD1	Q16676	465 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.05	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		33.04	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.88
PUF60-222	ENST00000533362	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	33.01	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	KIF1B	O60333	1816 aa		33	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	MED14	O60244	1454 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.98	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
PUF60-222	ENST00000533362	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.94	■■■□□ 2.86

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