RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.59	■■■□□ 2.97
PTPRK-222	ENST00000532751	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.58	■■■□□ 2.97
PTPRK-222	ENST00000532751	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.97
PTPRK-222	ENST00000532751	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.57	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	NCOA1	Q15788	1441 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	ZMYM3	Q14202	1370 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PTPRK-222	ENST00000532751	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		33.49	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	ITGAE	P38570	1179 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	33.46	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.45	■■■□□ 2.95
PTPRK-222	ENST00000532751	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.44	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	NPAT	Q14207	1427 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	CEP152	O94986	1710 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PTPRK-222	ENST00000532751	ABCC3	O15438	1527 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PTPRK-222	ENST00000532751	KANK1	Q14678	1352 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PTPRK-222	ENST00000532751	PZP	P20742	1482 aa		33.35	■■■□□ 2.93
PTPRK-222	ENST00000532751	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.34	■■■□□ 2.93	1e-6	■■□□□ 13
PTPRK-222	ENST00000532751	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		33.31	■■■□□ 2.92
PTPRK-222	ENST00000532751	HSPA2	P54652	639 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPRK-222	ENST00000532751	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		33.28	■■■□□ 2.92
PTPRK-222	ENST00000532751	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	TNR	Q92752	1358 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	UNC13B	O14795	1591 aa		33.21	■■■□□ 2.91
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PTPRK-222	ENST00000532751	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	33.18	■■■□□ 2.9
PTPRK-222	ENST00000532751	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PTPRK-222	ENST00000532751	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.17	■■■□□ 2.9
PTPRK-222	ENST00000532751	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PTPRK-222	ENST00000532751	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	NAIP	Q13075	1403 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	NLRP1	Q9C000	1473 aa		33.11	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	TET3	O43151	1660 aa		33.1	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		33.09	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	HFM1	A2PYH4	1435 aa		33.08	■■■□□ 2.89
PTPRK-222	ENST00000532751	STRC	Q7RTU9	1775 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRK-222	ENST00000532751	NUP155	O75694	1391 aa		33.06	■■■□□ 2.88
PTPRK-222	ENST00000532751	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
PTPRK-222	ENST00000532751	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751	PLA2R1	Q13018	1463 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		33	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751		E9PCH4	1651 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751	NOS1	P29475	1434 aa		32.95	■■■□□ 2.87
PTPRK-222	ENST00000532751	SYNM	O15061	1565 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	PKD2	Q13563	968 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.91	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	PTPRT	O14522	1441 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.89	■■■□□ 2.86
PTPRK-222	ENST00000532751	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.88	■■■□□ 2.85
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PTPRK-222	ENST00000532751	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.85	■■■□□ 2.85
PTPRK-222	ENST00000532751	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.85	■■■□□ 2.85
PTPRK-222	ENST00000532751	IDI1	Q13907	227 aa		32.84	■■■□□ 2.85
PTPRK-222	ENST00000532751	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PTPRK-222	ENST00000532751	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PTPRK-222	ENST00000532751	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
PTPRK-222	ENST00000532751	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PTPRK-222	ENST00000532751	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PTPRK-222	ENST00000532751	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	SLIT1	O75093	1534 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		32.71	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	MED14	O60244	1454 aa		32.7	■■■□□ 2.83
PTPRK-222	ENST00000532751	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.7	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		32.67	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.66	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	TRPM2	O94759	1503 aa		32.64	■■■□□ 2.82
PTPRK-222	ENST00000532751	LTK	P29376	864 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PTPRK-222	ENST00000532751	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		32.61	■■■□□ 2.81
PTPRK-222	ENST00000532751	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
PTPRK-222	ENST00000532751	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTPRK-222	ENST00000532751	KIF1B	O60333	1816 aa		32.58	■■■□□ 2.81
PTPRK-222	ENST00000532751	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.55	■■■□□ 2.8
PTPRK-222	ENST00000532751	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
PTPRK-222	ENST00000532751	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.54	■■■□□ 2.8
PTPRK-222	ENST00000532751	HRC	P23327	699 aa		32.54	■■■□□ 2.8

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