RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 JPH4Q96JJ6 628 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.29□□□□□ -1.56
RNU6-344P-201ENST00000516635 LMOD2Q6P5Q4 547 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-344P-201ENST00000516635 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-344P-201ENST00000516635 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUTM2FA1L443 756 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP3K7O43318 606 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSEN2P49810 448 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 TYW1BQ6NUM6 668 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL9A1P20849 921 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 EPAS1Q99814 870 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR37O15354 613 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNK17Q96T54 332 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 FECHP22830 423 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXW7Q969H0 707 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTGDRQ13258 359 aa5.22□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPRNQ4KMQ1 711 aa5.22□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPREP23469 700 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 PROX2Q3B8N5 592 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP33O14559 1287 aa5.2□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM161AQ3B820 660 aa5.2□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.2□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 C3orf80F5H4A9 247 aa5.19□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 PADI6Q6TGC4 694 aa5.19□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 FCHSD2O94868 740 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSKSQ9UJT2 592 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNPATO15228 680 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZMYND10O75800 440 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRSS12P56730 875 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDCA7LQ96GN5 454 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBED2Q9BTP6 218 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMAPO00193 183 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 PBX2P40425 430 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIC1Q14526 733 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.16□□□□□ -1.58
RNU6-344P-201ENST00000516635 BARGINQ6ZT62 677 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA1468Q9P260 1216 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC13Q8NBP0 860 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 CERKQ8TCT0 537 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 NLRP7Q8WX94 980 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNH8Q96L42 1107 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHOX2BQ99453 314 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC102AQ96A19 550 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 HCSTQ9UBK5 93 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.13□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 IRF6O14896 467 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 MAP2K5Q13163 448 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 PNMA3Q9UL41 463 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 HRO43593 1189 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 TATDN2Q93075 761 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC4A5Q9BY07 1137 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 RABGEF1Q9UJ41 708 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 TK2O00142 265 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 PACS2Q86VP3 889 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 EYA1Q99502 592 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q6ZNB5 142 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-344P-201ENST00000516635 RCCD1A6NED2 376 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF26B4DH59 902 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM66O15016 1216 aa5.08□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 AK7Q96M32 723 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 OATP04181 439 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 NBPF3Q9H094 633 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-344P-201ENST00000516635 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms