RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511398.1

LNX1-207, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 4

Gene LNX1, Length 622 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-207ENST00000511398 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa11.95□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa11.95□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.95□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.95□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.95□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 TSPY4P0CV99 314 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 TSPY10P0CW01 314 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 AFAP1Q8N556 730 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 CROCC2H7BZ55 1655 aa11.94□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ATP7AQ04656 1500 aa11.93□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.93□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ATP10AO60312 1499 aa11.92□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.91□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.91□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 C9orf84Q5VXU9 1444 aa11.91□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 MLH3Q9UHC1 1453 aa11.9□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ABCA6Q8N139 1617 aa11.9□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 FBXO41Q8TF61 875 aa11.9□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
LNX1-207ENST00000511398 MBD5Q9P267 1494 aa11.89□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.89□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 DAPK1P53355 1430 aa11.88□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 ITGAEP38570 1179 aa11.88□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.88□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 SHANK2Q9UPX8 1470 aa11.87□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.86□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 PLXNC1O60486 1568 aa11.85□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 ABCC5O15440 1437 aa11.85□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 A2MP01023 1474 aa11.84□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa11.84□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 CHIC2Q9UKJ5 165 aa11.84□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 REREQ9P2R6 1566 aa11.84□□□□□ -0.51
LNX1-207ENST00000511398 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.83□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 DUOX2Q9NRD8 1548 aa11.81□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 KIF15Q9NS87 1388 aa11.8□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.8□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa11.8□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 CERKQ8TCT0 537 aa11.79□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 AGLP35573 1532 aa11.79□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 ADGRL2O95490 1459 aa11.78□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 C3P01024 1663 aa11.78□□□□□ -0.52
LNX1-207ENST00000511398 KIF3BO15066 747 aa11.77□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 ERBINQ96RT1 1412 aa11.77□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 GGT6Q6P531 493 aa11.76□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 NCOA1Q15788 1441 aa11.76□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.75□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.75□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 SPDYE6P0CI01 402 aa11.75□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.75□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 ROCK1Q13464 1354 aa11.75□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 KANK1Q14678 1352 aa11.74□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 PTPRKQ15262 1439 aa11.73□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 STRCQ7RTU9 1775 aa11.73□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.73□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.72□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 PKD2Q13563 968 aa11.72□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.71□□□□□ -0.53
LNX1-207ENST00000511398 CEP152O94986 1710 aa11.71□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 MROH2AA6NES4 1674 aa11.71□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.7□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.7□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 PLCB2Q00722 1185 aa11.7□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 ZMYM3Q14202 1370 aa11.69□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 DEPDC5O75140 1603 aa11.69□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 HFM1A2PYH4 1435 aa11.68□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 UNC13BO14795 1591 aa11.67□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.67□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 KLHL34Q8N239 644 aa11.67□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.67□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 NAIPQ13075 1403 aa11.66□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.65□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 TRIM52Q96A61 297 aa11.65□□□□□ -0.54
LNX1-207ENST00000511398 ABCC3O15438 1527 aa11.65□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 PTPRTO14522 1441 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 NPATQ14207 1427 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.64□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 SETD5Q9C0A6 1442 aa11.63□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
LNX1-207ENST00000511398 NUP155O75694 1391 aa11.63□□□□□ -0.55
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