RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa15.35■□□□□ 0.05
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SH3BP2-209ENST00000504450 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.27■□□□□ 0.03
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SH3BP2-209ENST00000504450 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa15.24■□□□□ 0.03
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SH3BP2-209ENST00000504450 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 CLTCL1P53675 1640 aa14.99□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 AGLP35573 1532 aa14.98□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.98□□□□□ -0.01
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SH3BP2-209ENST00000504450 CEP152O94986 1710 aa14.97□□□□□ -0.01
SH3BP2-209ENST00000504450 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
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