RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 BCORL1Q5H9F3 1711 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 SCAPERQ9BY12 1400 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 MIER1Q8N108 512 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 GLI2P10070 1586 aa7□□□□□ -1.29
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ANKRD28-212ENST00000497037 CD109Q6YHK3 1445 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7□□□□□ -1.29
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ANKRD28-212ENST00000497037 MROH2AA6NES4 1674 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 TET3O43151 1660 aa6.99□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 CLTCL1P53675 1640 aa6.99□□□□□ -1.29
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ANKRD28-212ENST00000497037 ATP10AO60312 1499 aa6.97□□□□□ -1.29
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ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 IFT172Q9UG01 1749 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 A2MP01023 1474 aa6.96□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 NEO1Q92859 1461 aa6.95□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.94□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 MADDQ8WXG6 1647 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.94□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 RALGAPBQ86X10 1494 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.93□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 KIF1BO60333 1816 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCC3O15438 1527 aa6.92□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 PIK3C2BO00750 1634 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 LAMC1P11047 1609 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-212ENST00000497037 PPLO60437 1756 aa6.9□□□□□ -1.3
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ANKRD28-212ENST00000497037 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.89□□□□□ -1.31
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ANKRD28-212ENST00000497037 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NPATQ14207 1427 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 ADGRB3O60242 1522 aa6.88□□□□□ -1.31
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ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NEURL4Q96JN8 1562 aa6.88□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 USP47Q96K76 1375 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC7Q96M83 1385 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 RGL3Q3MIN7 710 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 REREQ9P2R6 1566 aa6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 KIF7Q2M1P5 1343 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 MYOM1P52179 1685 aa6.86□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.316e-8■■■■■ 27.4
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ANKRD28-212ENST00000497037 CNTLNQ9NXG0 1405 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.85□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NOS1P29475 1434 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.84□□□□□ -1.31
ANKRD28-212ENST00000497037 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 GGT6Q6P531 493 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 KANK1Q14678 1352 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 MYOM2P54296 1465 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC184Q52MB2 194 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 AGLP35573 1532 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-212ENST00000497037 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.82□□□□□ -1.32
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