RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.32■■□□□ 1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.31■■□□□ 1.8
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TSPAN4-212ENST00000494815 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.29■■□□□ 1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 DEPDC5O75140 1603 aa26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.27■■□□□ 1.8
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TSPAN4-212ENST00000494815 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.24■■□□□ 1.79
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TSPAN4-212ENST00000494815 ATP10AO60312 1499 aa26.21■■□□□ 1.79
TSPAN4-212ENST00000494815 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.21■■□□□ 1.79
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.19■■□□□ 1.78
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TSPAN4-212ENST00000494815 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN4-212ENST00000494815 KANK1Q14678 1352 aa26.17■■□□□ 1.78
TSPAN4-212ENST00000494815 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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TSPAN4-212ENST00000494815 TET3O43151 1660 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN4-212ENST00000494815 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN4-212ENST00000494815 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.12■■□□□ 1.77
TSPAN4-212ENST00000494815 RICTORQ6R327 1708 aa26.11■■□□□ 1.77
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TSPAN4-212ENST00000494815 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.09■■□□□ 1.77
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TSPAN4-212ENST00000494815 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
TSPAN4-212ENST00000494815 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.07■■□□□ 1.76
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TSPAN4-212ENST00000494815 TRPM2O94759 1503 aa26.04■■□□□ 1.76
TSPAN4-212ENST00000494815 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.04■■□□□ 1.76
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TSPAN4-212ENST00000494815 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.01■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.99■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 TSPOAP1O95153 1857 aa25.95■■□□□ 1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.94■■□□□ 1.74
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TSPAN4-212ENST00000494815 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-212ENST00000494815 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-212ENST00000494815 RGL3Q3MIN7 710 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-212ENST00000494815 CEP152O94986 1710 aa25.91■■□□□ 1.74
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TSPAN4-212ENST00000494815 USP47Q96K76 1375 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-212ENST00000494815 GGT6Q6P531 493 aa25.89■■□□□ 1.73
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TSPAN4-212ENST00000494815 STAC3Q96MF2 364 aa25.86■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.85■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.85■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 NPATQ14207 1427 aa25.84■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.84■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC7Q96M83 1385 aa25.83■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 REREQ9P2R6 1566 aa25.83■■□□□ 1.73
TSPAN4-212ENST00000494815 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.82■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 LAMC1P11047 1609 aa25.79■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.77■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 AGLP35573 1532 aa25.76■■□□□ 1.72
TSPAN4-212ENST00000494815 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
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TSPAN4-212ENST00000494815 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 MADDQ8WXG6 1647 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 ANP32CO43423 234 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 NOS1P29475 1434 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPAN4-212ENST00000494815 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 ADGRB3O60242 1522 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 MYOM2P54296 1465 aa25.7■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.69■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.67■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 CCER2I3L3R5 266 aa25.65■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 MROH2AA6NES4 1674 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 PIK3C2BO00750 1634 aa25.64■■□□□ 1.7
TSPAN4-212ENST00000494815 IFT172Q9UG01 1749 aa25.64■■□□□ 1.69
TSPAN4-212ENST00000494815 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
TSPAN4-212ENST00000494815 SYNMO15061 1565 aa25.63■■□□□ 1.69
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