RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.78■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 DEPDC5O75140 1603 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.77■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.75■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 KANK1Q14678 1352 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 UNC13BO14795 1591 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 TRIM52Q96A61 297 aa23.74■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 NUP155O75694 1391 aa23.73■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.73■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 MADDQ8WXG6 1647 aa23.72■■□□□ 1.39
RAI1-204ENST00000489697 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.7■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.7■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ABCC3O15438 1527 aa23.69■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 HRCP23327 699 aa23.69■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.68■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 CEP152O94986 1710 aa23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.64■■□□□ 1.38
RAI1-204ENST00000489697 ZMYM3Q14202 1370 aa23.64■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.63■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.63■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PZPP20742 1482 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 PTPRMP28827 1452 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.6■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 MROH2AA6NES4 1674 aa23.59■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.58■■□□□ 1.37
RAI1-204ENST00000489697 TET3O43151 1660 aa23.58■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 C3P01024 1663 aa23.56■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 NPATQ14207 1427 aa23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 PKD2Q13563 968 aa23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
RAI1-204ENST00000489697 E9PCH4 1651 aa23.51■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 FOXD1Q16676 465 aa23.49■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 ERVK-7P63135 1459 aa23.47■■□□□ 1.35
RAI1-204ENST00000489697 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 NOS1P29475 1434 aa23.45■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 TNRQ92752 1358 aa23.44■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 PTPRTO14522 1441 aa23.4■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
RAI1-204ENST00000489697 PLA2R1Q13018 1463 aa23.39■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SYNMO15061 1565 aa23.38■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.38■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 IDI1Q13907 227 aa23.35■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.35■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 TRPM2O94759 1503 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.34■■□□□ 1.33
RAI1-204ENST00000489697 NLRP1Q9C000 1473 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.32■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 PIK3C2BO00750 1634 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CLTCL1P53675 1640 aa23.29■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.28■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
RAI1-204ENST00000489697 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 ADGRB3O60242 1522 aa23.21■■□□□ 1.31
RAI1-204ENST00000489697 HSPA2P54652 639 aa23.2■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.2■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.19■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 KIF1BO60333 1816 aa23.18■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 NEUROD1Q13562 356 aa23.17■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 RGL3Q3MIN7 710 aa23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.15■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.15■■□□□ 1.3
RAI1-204ENST00000489697 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.14■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.13■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 SLIT1O75093 1534 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.09■■□□□ 1.29
RAI1-204ENST00000489697 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.08■■□□□ 1.29
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