RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487163.5

USP21-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP21, Length 2,514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-208ENST00000487163 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP21-208ENST00000487163 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.1■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.09■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 UNC13BO14795 1591 aa23.08■■□□□ 1.29
USP21-208ENST00000487163 PLA2R1Q13018 1463 aa23.07■■□□□ 1.28
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USP21-208ENST00000487163 PLXNC1O60486 1568 aa23.06■■□□□ 1.28
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USP21-208ENST00000487163 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.01■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23■■□□□ 1.27
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USP21-208ENST00000487163 A2MP01023 1474 aa22.98■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 AFAP1Q8N556 730 aa22.96■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 ERBINQ96RT1 1412 aa22.96■■□□□ 1.27
USP21-208ENST00000487163 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.94■■□□□ 1.26
USP21-208ENST00000487163 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.94■■□□□ 1.26
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USP21-208ENST00000487163 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.84■■□□□ 1.25
USP21-208ENST00000487163 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.84■■□□□ 1.25
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USP21-208ENST00000487163 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.81■■□□□ 1.24
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USP21-208ENST00000487163 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-208ENST00000487163 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.8■■□□□ 1.24
USP21-208ENST00000487163 RALBP1Q15311 655 aa22.79■■□□□ 1.24
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USP21-208ENST00000487163 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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USP21-208ENST00000487163 ASXL2Q76L83 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
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USP21-208ENST00000487163 MADDQ8WXG6 1647 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 NLRP13Q86W25 1043 aa22.69■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 CEP152O94986 1710 aa22.68■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 PTPRTO14522 1441 aa22.68■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 TET3O43151 1660 aa22.67■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 OSCARQ8IYS5 282 aa22.67■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 KANK1Q14678 1352 aa22.67■■□□□ 1.22
USP21-208ENST00000487163 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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USP21-208ENST00000487163 IQGAP1P46940 1657 aa22.62■■□□□ 1.21
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USP21-208ENST00000487163 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP21-208ENST00000487163 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.51■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 CD109Q6YHK3 1445 aa22.5■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 KIF1BO60333 1816 aa22.49■■□□□ 1.19
USP21-208ENST00000487163 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.49■■□□□ 1.19
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