RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	ADGRL1	O94910	1474 aa		13.28	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	ABCC1	P33527	1531 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		13.26	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	KDM5C	P41229	1560 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		13.25	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		13.24	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K13	O43283	966 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.23	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	NCOA2	Q15596	1464 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		13.22	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.21	□□□□□ -0.29
USP34-208	ENST00000467128	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.21	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.2	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	C7	P10643	843 aa		13.19	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.18	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	RERE	Q9P2R6	1566 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	FKBP8	Q14318	412 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.17	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		13.16	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	NUBP1	P53384	320 aa		13.15	□□□□□ -0.3
USP34-208	ENST00000467128	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.14	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.12	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	MBD5	Q9P267	1494 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.11	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	ATP10A	O60312	1499 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.1	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	TIE1	P35590	1138 aa		13.09	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	AGL	P35573	1532 aa		13.08	□□□□□ -0.31
USP34-208	ENST00000467128	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.08	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.07	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.06	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.05	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	POTEM	A6NI47	508 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.04	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.03	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	MADD	Q8WXG6	1647 aa		13.02	□□□□□ -0.32
USP34-208	ENST00000467128	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.02	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		13.02	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	POTEG	Q6S5H5	508 aa		13.01	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	A2M	P01023	1474 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		12.99	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.98	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	PTPRM	P28827	1452 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.97	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	MROH2A	A6NES4	1674 aa		12.96	□□□□□ -0.33
USP34-208	ENST00000467128	DAPK1	P53355	1430 aa		12.96	□□□□□ -0.34
USP34-208	ENST00000467128	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	12.95	□□□□□ -0.34
USP34-208	ENST00000467128	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP34-208	ENST00000467128	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP34-208	ENST00000467128	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		12.95	□□□□□ -0.34
USP34-208	ENST00000467128	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34

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