RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PTPRU-206ENST00000465525 DEPDC5O75140 1603 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 NUP155O75694 1391 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.44■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 PZPP20742 1482 aa25.42■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 GGT6Q6P531 493 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.4■■□□□ 1.66
PTPRU-206ENST00000465525 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.39■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 MLECQ14165 292 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.38■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 CEP152O94986 1710 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 FOXD1Q16676 465 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRU-206ENST00000465525 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 KANK1Q14678 1352 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 PKD2Q13563 968 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 TET3O43151 1660 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC3O15438 1527 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 E9PCH4 1651 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.2■■□□□ 1.63
PTPRU-206ENST00000465525 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 MADDQ8WXG6 1647 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 ZMYM3Q14202 1370 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRU-206ENST00000465525 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 NEUROD1Q13562 356 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 NPATQ14207 1427 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 MROH2AA6NES4 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 PLA2R1Q13018 1463 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PTPRU-206ENST00000465525 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 TRPM2O94759 1503 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRMP28827 1452 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRTO14522 1441 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 C3P01024 1663 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRU-206ENST00000465525 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 CLTCL1P53675 1640 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 SYNMO15061 1565 aa25■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 ERVK-7P63135 1459 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 NOS1P29475 1434 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRU-206ENST00000465525 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 TNRQ92752 1358 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 TONSLQ96HA7 1378 aa24.92■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 KIF1BO60333 1816 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 PIK3C2BO00750 1634 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRU-206ENST00000465525 IDI1Q13907 227 aa24.87■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 RGL3Q3MIN7 710 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 NLRP1Q9C000 1473 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRU-206ENST00000465525 ADGRB3O60242 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.78■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.77■■□□□ 1.56
PTPRU-206ENST00000465525 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.76■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 IFT172Q9UG01 1749 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 PPLO60437 1756 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRU-206ENST00000465525 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PTPRU-206ENST00000465525 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
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