RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.282e-34■■■■□ 20.9
ACTB-207ENST00000462494 TMC1Q8TDI8 760 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.01■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 SHROOM2Q13796 1616 aa22.99■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 ABCC2Q92887 1545 aa22.97■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.96■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.95■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.95■■□□□ 1.27
ACTB-207ENST00000462494 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.95■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 UNC13BO14795 1591 aa22.94■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 PLA2R1Q13018 1463 aa22.93■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 NUDCQ9Y266 331 aa22.92■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.91■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 RALBP1Q15311 655 aa22.9■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 PLXNC1O60486 1568 aa22.89■■□□□ 1.26
ACTB-207ENST00000462494 A2MP01023 1474 aa22.89■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.87■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 PLCH2O75038 1416 aa22.86■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 E9PCH4 1651 aa22.85■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ACTB-207ENST00000462494 ERBINQ96RT1 1412 aa22.83■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.82■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.8■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 NLRP13Q86W25 1043 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 TESK2Q96S53 571 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.78■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
ACTB-207ENST00000462494 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 ABCC1P33527 1531 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 ATP10AO60312 1499 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 MSH5O43196 834 aa22.76■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 AFAP1Q8N556 730 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.75■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 TMF1P82094 1093 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.74■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 LAMC1P11047 1609 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 PANK3Q9H999 370 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.73■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.72■■□□□ 1.23
ACTB-207ENST00000462494 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.67■■□□□ 1.22
ACTB-207ENST00000462494 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.66■■□□□ 1.22
ACTB-207ENST00000462494 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.64■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.63■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.62■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.61■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 TRPM2O94759 1503 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 MADDQ8WXG6 1647 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 PDE3BQ13370 1112 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-207ENST00000462494 KIF3BO15066 747 aa22.58■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 FANCAO15360 1455 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 KANK1Q14678 1352 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 CLTCL1P53675 1640 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 PTPRTO14522 1441 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 CEP152O94986 1710 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 ATP7AQ04656 1500 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 DEPDC5O75140 1603 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 IQGAP1P46940 1657 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 TET3O43151 1660 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-207ENST00000462494 CDCA8Q53HL2 280 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 STAC3Q96MF2 364 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 ADGRL1O94910 1474 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.49■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 PPP2R1AP30153 589 aa22.48■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 INSRP06213 1382 aa22.47■■□□□ 1.19
ACTB-207ENST00000462494 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
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