RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462392.5

IMP4-210, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 1,793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-210ENST00000462392 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.52■■■□□ 2.32
IMP4-210ENST00000462392 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
IMP4-210ENST00000462392 TSPOAP1O95153 1857 aa29.47■■■□□ 2.31
IMP4-210ENST00000462392 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.46■■■□□ 2.31
IMP4-210ENST00000462392 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
IMP4-210ENST00000462392 RICTORQ6R327 1708 aa29.46■■■□□ 2.31
IMP4-210ENST00000462392 A2MP01023 1474 aa29.45■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 DEPDC5O75140 1603 aa29.45■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 KIF3BO15066 747 aa29.44■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.44■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.44■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 ABCA6Q8N139 1617 aa29.4■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.39■■■□□ 2.3
IMP4-210ENST00000462392 KANK1Q14678 1352 aa29.36■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.35■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.34■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 PLA2R1Q13018 1463 aa29.33■■■□□ 2.29
IMP4-210ENST00000462392 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.29■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 ATP10AO60312 1499 aa29.28■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 TET3O43151 1660 aa29.28■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 E9PCH4 1651 aa29.27■■■□□ 2.28
IMP4-210ENST00000462392 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.26■■■□□ 2.27
IMP4-210ENST00000462392 GGT6Q6P531 493 aa29.22■■■□□ 2.27
IMP4-210ENST00000462392 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.21■■■□□ 2.27
IMP4-210ENST00000462392 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
IMP4-210ENST00000462392 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.2■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 PTPRTO14522 1441 aa29.17■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.17■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 TRPM2O94759 1503 aa29.16■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 CEP152O94986 1710 aa29.15■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.14■■■□□ 2.26
IMP4-210ENST00000462392 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.13■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.11■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.11■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 ABCC3O15438 1527 aa29.1■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.1■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 RGL3Q3MIN7 710 aa29.09■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.08■■■□□ 2.25
IMP4-210ENST00000462392 REREQ9P2R6 1566 aa29.07■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 CLTCL1P53675 1640 aa29.05■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 NPATQ14207 1427 aa29.04■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.04■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.02■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 AGLP35573 1532 aa29.01■■■□□ 2.24
IMP4-210ENST00000462392 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.01■■■□□ 2.23
IMP4-210ENST00000462392 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
IMP4-210ENST00000462392 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.98■■■□□ 2.23
IMP4-210ENST00000462392 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.98■■■□□ 2.23
IMP4-210ENST00000462392 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.96■■■□□ 2.23
IMP4-210ENST00000462392 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.95■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.93■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.91■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 NOS1P29475 1434 aa28.9■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.89■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
IMP4-210ENST00000462392 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.86■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.86■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 USP47Q96K76 1375 aa28.86■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 KIF1BO60333 1816 aa28.86■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 MIER1Q8N108 512 aa28.85■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 MLECQ14165 292 aa28.84■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 STAC3Q96MF2 364 aa28.84■■■□□ 2.21
IMP4-210ENST00000462392 SYNMO15061 1565 aa28.82■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 ADGRB3O60242 1522 aa28.8■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 MROH2AA6NES4 1674 aa28.8■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.79■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 MADDQ8WXG6 1647 aa28.79■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.78■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 PIK3C2BO00750 1634 aa28.78■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.77■■■□□ 2.2
IMP4-210ENST00000462392 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 MYOM2P54296 1465 aa28.73■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.73■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 ERVK-7P63135 1459 aa28.72■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 IFT172Q9UG01 1749 aa28.71■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 IDI1Q13907 227 aa28.71■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 LAMC1P11047 1609 aa28.71■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 CCDC7Q96M83 1385 aa28.71■■■□□ 2.19
IMP4-210ENST00000462392 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
IMP4-210ENST00000462392 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.68■■■□□ 2.18
IMP4-210ENST00000462392 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms