RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462392.5

IMP4-210, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene IMP4, Length 1,793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-210ENST00000462392 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.48■■■■■ 5.03
IMP4-210ENST00000462392 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.48■■■■■ 4.07
IMP4-210ENST00000462392 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
IMP4-210ENST00000462392 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.47■■■■□ 3.75
IMP4-210ENST00000462392 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.4■■■■□ 3.74
IMP4-210ENST00000462392 ABCC9O60706 1549 aa38.38■■■■□ 3.73
IMP4-210ENST00000462392 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.99■■■■□ 3.67
IMP4-210ENST00000462392 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.94■■■■□ 3.66
IMP4-210ENST00000462392 NACADO15069 1562 aa37.73■■■■□ 3.63
IMP4-210ENST00000462392 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.41■■■■□ 3.58
IMP4-210ENST00000462392 SCRIBQ14160 1630 aa37.29■■■■□ 3.56
IMP4-210ENST00000462392 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.64■■■■□ 3.46
IMP4-210ENST00000462392 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
IMP4-210ENST00000462392 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.3■■■■□ 3.4
IMP4-210ENST00000462392 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.22■■■■□ 3.39
IMP4-210ENST00000462392 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.16■■■■□ 3.38
IMP4-210ENST00000462392 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
IMP4-210ENST00000462392 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.94■■■■□ 3.34
IMP4-210ENST00000462392 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
IMP4-210ENST00000462392 SMARCA4P51532 1647 aa35.72■■■■□ 3.31
IMP4-210ENST00000462392 WIZO95785 1651 aa35.63■■■■□ 3.29
IMP4-210ENST00000462392 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.27■■■■□ 3.24
IMP4-210ENST00000462392 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
IMP4-210ENST00000462392 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
IMP4-210ENST00000462392 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.16■■■■□ 3.22
IMP4-210ENST00000462392 SMARCA2P51531 1590 aa35.12■■■■□ 3.21
IMP4-210ENST00000462392 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.97■■■■□ 3.19
IMP4-210ENST00000462392 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
IMP4-210ENST00000462392 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.91■■■■□ 3.18
IMP4-210ENST00000462392 NCAPD3P42695 1498 aa34.85■■■■□ 3.17
IMP4-210ENST00000462392 HMGXB3Q12766 1538 aa34.78■■■■□ 3.16
IMP4-210ENST00000462392 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.7■■■■□ 3.14
IMP4-210ENST00000462392 TRIM41Q8WV44 630 aa34.35■■■■□ 3.09
IMP4-210ENST00000462392 ABCC8Q09428 1581 aa34.19■■■■□ 3.06
IMP4-210ENST00000462392 CFTRP13569 1480 aa34.08■■■■□ 3.05
IMP4-210ENST00000462392 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.97■■■■□ 3.03
IMP4-210ENST00000462392 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.97■■■■□ 3.03
IMP4-210ENST00000462392 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.9■■■■□ 3.02
IMP4-210ENST00000462392 PRDM2Q13029 1718 aa33.83■■■■□ 3.01
IMP4-210ENST00000462392 SYNJ1O43426 1573 aa33.81■■■■□ 3
IMP4-210ENST00000462392 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
IMP4-210ENST00000462392 NESP48681 1621 aa33.69■■■□□ 2.98
IMP4-210ENST00000462392 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.66■■■□□ 2.98
IMP4-210ENST00000462392 TOP2BQ02880 1626 aa33.66■■■□□ 2.98
IMP4-210ENST00000462392 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.64■■■□□ 2.98
IMP4-210ENST00000462392 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.61■■■□□ 2.97
IMP4-210ENST00000462392 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.6■■■□□ 2.97
IMP4-210ENST00000462392 CUX1P39880 1505 aa33.59■■■□□ 2.97
IMP4-210ENST00000462392 SOGA1O94964 1423 aa33.56■■■□□ 2.96
IMP4-210ENST00000462392 EEA1Q15075 1411 aa33.44■■■□□ 2.94
IMP4-210ENST00000462392 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.43■■■□□ 2.94
IMP4-210ENST00000462392 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.41■■■□□ 2.94
IMP4-210ENST00000462392 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.37■■■□□ 2.93
IMP4-210ENST00000462392 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.31■■■□□ 2.92
IMP4-210ENST00000462392 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.3■■■□□ 2.92
IMP4-210ENST00000462392 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.27■■■□□ 2.92
IMP4-210ENST00000462392 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.24■■■□□ 2.91
IMP4-210ENST00000462392 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.23■■■□□ 2.91
IMP4-210ENST00000462392 TOPBP1Q92547 1522 aa33.23■■■□□ 2.91
IMP4-210ENST00000462392 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
IMP4-210ENST00000462392 KIF27Q86VH2 1401 aa33.1■■■□□ 2.89
IMP4-210ENST00000462392 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
IMP4-210ENST00000462392 CUX2O14529 1486 aa33.03■■■□□ 2.88
IMP4-210ENST00000462392 GOLGA3Q08378 1498 aa33■■■□□ 2.87
IMP4-210ENST00000462392 KIF21BO75037 1637 aa33■■■□□ 2.87
IMP4-210ENST00000462392 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.98■■■□□ 2.87
IMP4-210ENST00000462392 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.98■■■□□ 2.87
IMP4-210ENST00000462392 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.92■■■□□ 2.86
IMP4-210ENST00000462392 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.9■■■□□ 2.86
IMP4-210ENST00000462392 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
IMP4-210ENST00000462392 ERCC6Q03468 1493 aa32.9■■■□□ 2.86
IMP4-210ENST00000462392 PRXQ9BXM0 1461 aa32.87■■■□□ 2.85
IMP4-210ENST00000462392 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.87■■■□□ 2.85
IMP4-210ENST00000462392 IGF1RP08069 1367 aa32.82■■■□□ 2.84
IMP4-210ENST00000462392 WDR62O43379 1518 aa32.8■■■□□ 2.84
IMP4-210ENST00000462392 WDR97A6NE52 1622 aa32.78■■■□□ 2.84
IMP4-210ENST00000462392 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.78■■■□□ 2.84
IMP4-210ENST00000462392 CEP162Q5TB80 1403 aa32.74■■■□□ 2.83
IMP4-210ENST00000462392 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
IMP4-210ENST00000462392 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
IMP4-210ENST00000462392 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
IMP4-210ENST00000462392 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.65■■■□□ 2.82
IMP4-210ENST00000462392 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.64■■■□□ 2.82
IMP4-210ENST00000462392 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.6■■■□□ 2.81
IMP4-210ENST00000462392 IFT140Q96RY7 1462 aa32.57■■■□□ 2.8
IMP4-210ENST00000462392 CUL7Q14999 1698 aa32.51■■■□□ 2.8
IMP4-210ENST00000462392 CLIP1P30622 1438 aa32.49■■■□□ 2.79
IMP4-210ENST00000462392 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.46■■■□□ 2.795e-7■■■■■ 37.2
IMP4-210ENST00000462392 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
IMP4-210ENST00000462392 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.4■■■□□ 2.78
IMP4-210ENST00000462392 PBRM1Q86U86 1689 aa32.37■■■□□ 2.77
IMP4-210ENST00000462392 GRIN2BQ13224 1484 aa32.34■■■□□ 2.77
IMP4-210ENST00000462392 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
IMP4-210ENST00000462392 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.24■■■□□ 2.75
IMP4-210ENST00000462392 ADAMTS12P58397 1594 aa32.22■■■□□ 2.75
IMP4-210ENST00000462392 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.19■■■□□ 2.74
IMP4-210ENST00000462392 ARAP1Q96P48 1450 aa32.16■■■□□ 2.74
IMP4-210ENST00000462392 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.16■■■□□ 2.74
IMP4-210ENST00000462392 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.14■■■□□ 2.74
IMP4-210ENST00000462392 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.14■■■□□ 2.74
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