RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.88■■■□□ 2.05
IMP4-208ENST00000460766 SHROOM2Q13796 1616 aa27.85■■■□□ 2.05
IMP4-208ENST00000460766 RGL3Q3MIN7 710 aa27.84■■■□□ 2.05
IMP4-208ENST00000460766 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.84■■■□□ 2.05
IMP4-208ENST00000460766 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.83■■■□□ 2.05
IMP4-208ENST00000460766 ABCC2Q92887 1545 aa27.82■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.81■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 TMC1Q8TDI8 760 aa27.81■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.79■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.78■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 UNC13BO14795 1591 aa27.77■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 PLA2R1Q13018 1463 aa27.76■■■□□ 2.04
IMP4-208ENST00000460766 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.75■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 ANP32EQ9BTT0 268 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 PLXNC1O60486 1568 aa27.73■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.71■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 NUDCQ9Y266 331 aa27.71■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 A2MP01023 1474 aa27.7■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.7■■■□□ 2.03
IMP4-208ENST00000460766 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 RALBP1Q15311 655 aa27.7■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.69■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 PLCH2O75038 1416 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.68■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 ERBINQ96RT1 1412 aa27.65■■■□□ 2.02
IMP4-208ENST00000460766 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.64■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 E9PCH4 1651 aa27.63■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 MAGI2Q86UL8 1455 aa27.6■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa27.59■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 ATP10AO60312 1499 aa27.58■■■□□ 2.01
IMP4-208ENST00000460766 ABCC1P33527 1531 aa27.57■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.56■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 TESK2Q96S53 571 aa27.56■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 NLRP13Q86W25 1043 aa27.56■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.55■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.54■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.54■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.54■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 LAMC1P11047 1609 aa27.52■■■□□ 2
IMP4-208ENST00000460766 AFAP1Q8N556 730 aa27.51■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 TMF1P82094 1093 aa27.5■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.5■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 PANK3Q9H999 370 aa27.48■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 MSH5O43196 834 aa27.46■■□□□ 1.99
IMP4-208ENST00000460766 CCDC136Q96JN2 1154 aa27.45■■□□□ 1.98
IMP4-208ENST00000460766 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.44■■□□□ 1.98
IMP4-208ENST00000460766 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.43■■□□□ 1.98
IMP4-208ENST00000460766 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.41■■□□□ 1.98
IMP4-208ENST00000460766 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.37■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 MYT1LQ9UL68 1186 aa27.37■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 TRPM2O94759 1503 aa27.36■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.35■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 MADDQ8WXG6 1647 aa27.34■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 FANCAO15360 1455 aa27.33■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 PDE3BQ13370 1112 aa27.33■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 RCAN3Q9UKA8 241 aa27.33■■□□□ 1.97
IMP4-208ENST00000460766 PTPRTO14522 1441 aa27.32■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 KANK1Q14678 1352 aa27.32■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 KIF3BO15066 747 aa27.31■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 ATP7AQ04656 1500 aa27.29■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 ERICH6Q7L0X2 663 aa27.29■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 STAC3Q96MF2 364 aa27.28■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 CLTCL1P53675 1640 aa27.28■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.28■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 CDCA7LQ96GN5 454 aa27.28■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.28■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 SCAPERQ9BY12 1400 aa27.27■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 DEPDC5O75140 1603 aa27.27■■□□□ 1.96
IMP4-208ENST00000460766 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 ADGRL1O94910 1474 aa27.25■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 CEP152O94986 1710 aa27.25■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 CDCA8Q53HL2 280 aa27.24■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 TET3O43151 1660 aa27.24■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 IQGAP1P46940 1657 aa27.24■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.24■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 INSRP06213 1382 aa27.22■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 EXOC6Q8TAG9 804 aa27.22■■□□□ 1.95
IMP4-208ENST00000460766 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.2■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.19■■□□□ 1.94
IMP4-208ENST00000460766 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms