RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 RICTORQ6R327 1708 aa30.73■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 TSPOAP1O95153 1857 aa30.71■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.71■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.51
CTU2-202ENST00000453996 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
CTU2-202ENST00000453996 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.67■■■□□ 2.5
CTU2-202ENST00000453996 ABCA6Q8N139 1617 aa30.65■■■□□ 2.5
CTU2-202ENST00000453996 A2MP01023 1474 aa30.64■■■□□ 2.5
CTU2-202ENST00000453996 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.61■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 RAPGEF3O95398 923 aa30.61■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.59■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.59■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.59■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
CTU2-202ENST00000453996 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 TET3O43151 1660 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 KANK1Q14678 1352 aa30.57■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 KIF3BO15066 747 aa30.56■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa30.56■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 E9PCH4 1651 aa30.54■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
CTU2-202ENST00000453996 ATP10AO60312 1499 aa30.51■■■□□ 2.47
CTU2-202ENST00000453996 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.5■■■□□ 2.47
CTU2-202ENST00000453996 PLA2R1Q13018 1463 aa30.49■■■□□ 2.47
CTU2-202ENST00000453996 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.45■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.44■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 CEP152O94986 1710 aa30.43■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.43■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.41■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 TRPM2O94759 1503 aa30.41■■■□□ 2.46
CTU2-202ENST00000453996 PTPRTO14522 1441 aa30.37■■■□□ 2.45
CTU2-202ENST00000453996 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.34■■■□□ 2.45
CTU2-202ENST00000453996 REREQ9P2R6 1566 aa30.32■■■□□ 2.45
CTU2-202ENST00000453996 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.32■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 ABCC3O15438 1527 aa30.31■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 GGT6Q6P531 493 aa30.31■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 CLTCL1P53675 1640 aa30.3■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.28■■■□□ 2.44
CTU2-202ENST00000453996 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.26■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.23■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.23■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 RALGAPBQ86X10 1494 aa30.23■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 AGLP35573 1532 aa30.22■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.22■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 NPATQ14207 1427 aa30.2■■■□□ 2.43
CTU2-202ENST00000453996 NEURL4Q96JN8 1562 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 RGL3Q3MIN7 710 aa30.19■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.18■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 KIF1BO60333 1816 aa30.17■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.16■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 UGGT1Q9NYU2 1555 aa30.14■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.14■■■□□ 2.42
CTU2-202ENST00000453996 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.14■■■□□ 2.41
CTU2-202ENST00000453996 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.13■■■□□ 2.41
CTU2-202ENST00000453996 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.13■■■□□ 2.41
CTU2-202ENST00000453996 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa30.12■■■□□ 2.41
CTU2-202ENST00000453996 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
CTU2-202ENST00000453996 MROH2AA6NES4 1674 aa30.06■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 NOS1P29475 1434 aa30.06■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 USP47Q96K76 1375 aa30.05■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 MADDQ8WXG6 1647 aa30.05■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 ADGRB3O60242 1522 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 PIK3C2BO00750 1634 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 LAMC1P11047 1609 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 SYNMO15061 1565 aa30.03■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 IFT172Q9UG01 1749 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 MIER1Q8N108 512 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 STAC3Q96MF2 364 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.02■■■□□ 2.4
CTU2-202ENST00000453996 CARD11Q9BXL7 1154 aa30.01■■■□□ 2.39
CTU2-202ENST00000453996 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
CTU2-202ENST00000453996 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
CTU2-202ENST00000453996 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.97■■■□□ 2.39
CTU2-202ENST00000453996 MYOM2P54296 1465 aa29.96■■■□□ 2.39
CTU2-202ENST00000453996 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.94■■■□□ 2.38
CTU2-202ENST00000453996 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.91■■■□□ 2.38
CTU2-202ENST00000453996 PPLO60437 1756 aa29.91■■■□□ 2.38
CTU2-202ENST00000453996 CCDC7Q96M83 1385 aa29.89■■■□□ 2.38
CTU2-202ENST00000453996 ERVK-7P63135 1459 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 MLECQ14165 292 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.88■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.85■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.84■■■□□ 2.37
CTU2-202ENST00000453996 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.82■■■□□ 2.36
CTU2-202ENST00000453996 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
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