RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.6■■■□□ 2.01
PTX4-202ENST00000440447 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PTX4-202ENST00000440447 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.58■■■□□ 2.01
PTX4-202ENST00000440447 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.55■■■□□ 2
PTX4-202ENST00000440447 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PTX4-202ENST00000440447 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.54■■■□□ 2
PTX4-202ENST00000440447 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
PTX4-202ENST00000440447 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.51■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 ZMYM3Q14202 1370 aa27.49■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.49■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 NAIPQ13075 1403 aa27.49■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 KANK1Q14678 1352 aa27.48■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.47■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 HFM1A2PYH4 1435 aa27.47■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PTX4-202ENST00000440447 DEPDC5O75140 1603 aa27.45■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 MROH2AA6NES4 1674 aa27.44■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 ABCC3O15438 1527 aa27.43■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 C3P01024 1663 aa27.4■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.4■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PTX4-202ENST00000440447 UNC13BO14795 1591 aa27.36■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.36■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 NUP155O75694 1391 aa27.35■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 PZPP20742 1482 aa27.34■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 CEP152O94986 1710 aa27.34■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 LMTK2Q8IWU2 1503 aa27.34■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 NPATQ14207 1427 aa27.33■■□□□ 1.97
PTX4-202ENST00000440447 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.32■■□□□ 1.96
PTX4-202ENST00000440447 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
PTX4-202ENST00000440447 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.3■■□□□ 1.96
PTX4-202ENST00000440447 TRIM52Q96A61 297 aa27.3■■□□□ 1.96
PTX4-202ENST00000440447 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa27.3■■□□□ 1.96
PTX4-202ENST00000440447 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.25■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.24■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 TNRQ92752 1358 aa27.24■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.24■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 TET3O43151 1660 aa27.22■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 ERVK-7P63135 1459 aa27.22■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.22■■□□□ 1.95
PTX4-202ENST00000440447 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.2■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.19■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.19■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 HRCP23327 699 aa27.14■■□□□ 1.94
PTX4-202ENST00000440447 NLRP1Q9C000 1473 aa27.13■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.12■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 NOS1P29475 1434 aa27.12■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 HSPA2P54652 639 aa27.11■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 PKD2Q13563 968 aa27.11■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 E9PCH4 1651 aa27.11■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.1■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.09■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTX4-202ENST00000440447 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.07■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 IDI1Q13907 227 aa27.04■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 SYNMO15061 1565 aa27.04■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 UGGT1Q9NYU2 1555 aa27.01■■□□□ 1.92
PTX4-202ENST00000440447 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.01■■□□□ 1.91
PTX4-202ENST00000440447 PTPRTO14522 1441 aa27■■□□□ 1.91
PTX4-202ENST00000440447 FOXD1Q16676 465 aa26.98■■□□□ 1.91
PTX4-202ENST00000440447 PIK3C2BO00750 1634 aa26.94■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.94■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 PLA2R1Q13018 1463 aa26.93■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 TRPM2O94759 1503 aa26.92■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.9■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 ADGRB3O60242 1522 aa26.9■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.89■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.89■■□□□ 1.9
PTX4-202ENST00000440447 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.89■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.87■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.84■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 EID1Q9Y6B2 187 aa26.84■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 CLTCL1P53675 1640 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.83■■□□□ 1.89
PTX4-202ENST00000440447 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.83■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 STRCQ7RTU9 1775 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 SLIT1O75093 1534 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.82■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.79■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 LTKP29376 864 aa26.78■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
PTX4-202ENST00000440447 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.76■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PTX4-202ENST00000440447 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
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